¿Cuántos codones posibles?

Considere un codón de la forma NNK (donde N = A denina, C itosina, G uanina o U racilo y K = U racilo o G uanina). ¿Cuántos codones hay ahora disponibles? Sé que si todos estuvieran disponibles, habría 4 ^ 3 = 64 codones. ¿Cuántos son posibles ahora? Cuando he probado combinaciones manualmente he conseguido que sea 32, ¿es correcto?

4 * 4 * 2 = 32.
¿Qué se entiende por N y NN de NNK? ¿Significa que los primeros 2 nucleótidos tienen que ser iguales?

Respuestas (2)

Sí, 32 es correcto.

Técnicamente, no tengo nada que agregar que Gerardo Furtado y un tigre no hayan mencionado ya, pero una representación gráfica de todas las permutaciones podría ayudar a entender esto un poco mejor.

Para las primeras 2 posiciones en el codón tenemos 4 bases para elegir ( a denina, guanina , u racilo y citosina ). Esto puede representarse matemáticamente como 4 x 4 = 16 o visualmente como:

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Ahora, para la siguiente posición (la posición de interés) solo tenemos dos bases para elegir ( u racil y g uanine). Dejándonos con 4 x 4 x 2 = 32 permutaciones diferentes, o visualmente:

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De nada. Me alegro de que haya ayudado.

Sí, lo es.

Gerardo Furtado ya ha dado una breve respuesta en los comentarios, pero permítanme explicar por qué.

El 4 ^ 3 = 64 si todas las bases se pueden elegir libremente se reduce a 4 * 4 * 4 = 64, porque puede elegir entre 4 opciones para cada una de las 3 bases.

Si restringe las posibilidades de una de las bases, por ejemplo, solo hay 2 opciones para la tercera base (como en su ejemplo), la fórmula cambia a 4*4*2=32, ya que puede elegir entre 4 opciones cada una para la 2 primeras bases y de 2 opciones para la 3ra base.

Editar: si las 2 'N' de 'NNK' tienen que ser iguales, puede elegir la primera base libremente (4 opciones), la segunda base ya está definida (tiene que ser igual que la primera base, 1 opción) y hay 2 opciones para la 3ra base como se describe arriba. Por lo tanto, obtenemos 4*1*2=8 codones posibles

Espero poder aclarar esto.

Buena explicación. Para completar, sería extremadamente inusual si NNKse indicara que las dos primeras bases tienen que ser idénticas: en primer lugar, no es la convención; Los códigos de ambigüedad de la IUPAC son caracteres comodín, no variables en el sentido matemático común. Y en segundo lugar, hay pocas razones biológicas para considerar codones donde las dos primeras bases son idénticas.
Estoy absolutamente de acuerdo.
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