En 1950, Bragg, Kendrew y Perutz publicaron " Configuraciones de cadenas polipeptídicas en proteínas cristalinas " ( acceso abierto ) y Pauling, Corey y Branson famosamente 'demostraron que estaban equivocados' al año siguiente, en el artículo que documentaba las hélices alfa y gamma, " Dos configuraciones helicoidales unidas por hidrógeno de la cadena polipeptídica " ( también OA )
Estoy leyendo sobre esto (como se revisó aquí, por ejemplo) donde la idea es que Bragg et al fueron refutados, en palabras del artículo de Pauling:
Ninguno de estos autores propone ni nuestra hélice [α] de 3,7 residuos ni nuestra hélice [γ] de 5,1 residuos. Por otro lado, eliminaríamos por nuestros postulados básicos todas las estructuras propuestas por ellos. La razón de la diferencia en los resultados obtenidos por otros investigadores y por nosotros a través de argumentos esencialmente similares es que tanto Bragg como sus colaboradores. . . discutido en detalle solo estructuras helicoidales con un número entero de residuos por vuelta, y además asume solo una aproximación aproximada a los requisitos sobre distancias interatómicas, ángulos de enlace y planaridad del grupo amida conjugado, como lo dan nuestras investigaciones de sustancias más simples. Sostenemos que estas características estereoquímicas deben conservarse muy de cerca en configuraciones estables de cadenas polipeptídicas en proteínas,
Sin embargo, había una, la hélice 3 10 , que fue identificada correctamente por el grupo de Perutz en 1950. Actualmente no tengo acceso a las instalaciones de la biblioteca y los recursos en línea no son lo mismo que un libro de texto sólido. Me pregunto si alguna de las otras formas descritas era correcta.
Para enumerar, estos fueron:
Continuaré buscando mientras tanto, pero es difícil buscar cuando hay subíndices en los nombres, y creo que los científicos de proteínas más experimentados podrían darme una respuesta más rápida (o simplemente indicarme dónde debería estar leyendo)
Creo que tienes la lista de buenas predicciones del artículo de Bragg, Perutz y Kendrick. Y la hélice 3 10 tampoco estaba bien; sin embargo, resultó aparecer ocasionalmente en estructuras de proteínas.
En ese momento, todos estos elementos de estructura secundaria estaban bien evidenciados a partir de datos de difracción no cristalina y estructuras cristalinas de moléculas pequeñas. Los ejemplos son colágeno del cabello y patrones de difracción de fibra de seda de araña. Difracción de fibra del cabello, cuya estructura ordenada consiste principalmente en hélices alfa algo alineadas con el eje de la fibra (a lo largo del cabello) o las láminas principalmente beta que constituyen la seda.
Porque se sabía que estas sustancias contienen principalmente proteínas, construyendo modelos que mostrarían cómo los polímeros peptídicos regulares producirían estos patrones. Esto sucedió en los departamentos de química y física en todo el mundo. El documento que cita es representativo del campo.
Pauling causó revuelo en la primavera de 1951 al publicar descripciones de la hélice alfa y la lámina beta (tanto paralelas como antiparalelas). La principal ventaja que tenía Pauling era que había estudiado la estructura de las estructuras de di-aminoácidos simples (en particular, la glicil-glicina) y comprendió que el enlace peptídico tenía algunas propiedades de doble enlace que le impedían girar libremente. Como descubridor de la teoría del enlace de valencia , que unió la mecánica cuántica y la química y estableció la base de al menos la mayoría de las estructuras químicas orgánicas/biológicas, Pauling debe haber estado prácticamente solo en esta idea en ese momento.
Este siguiente preparó el escenario para la carrera dramática para descubrir la estructura del ADN. Si lees las memorias de Watsons , describe cómo el MRC en Cambridge todavía estaba sintiendo el calor, compitiendo con CalTech y Pauling. Él y el joven laboratorio se defendían contra el MRC Cambridge con sus múltiples premios nobel; un laboratorio que había establecido la relación entre la difracción de rayos X y la estructura química (las notas del capítulo 7 son interesantes; siga el enlace).
Mirando hacia atrás, la principal ventaja de Pauling fue que entendió el enlace peptídico mejor que el resto del mundo. En el momento en que se estaba resolviendo el ADN, muchos entendían las conformaciones de las moléculas orgánicas y el campo de juego debería haber sido más nivelado. No estoy seguro de aceptar los argumentos de que Pauling habría obtenido la estructura sin ver los patrones de difracción y, aun así, tal vez no. Puede que no le dé tanta credibilidad a la idea de que Pauling habría obtenido la estructura del ADN tan rápido si hubiera podido viajar.
Por supuesto, Perutz y Kendrew verificaron ellos mismos la hélice alfa del péptido cuando resolvieron las primeras estructuras cristalinas de la hemoglobina y la mioglobina, teniendo la última palabra. Las estructuras contienen una pequeña cantidad de 3 10 hélices, pero por lo demás están llenas de hélices alfa. No estoy seguro de que la estructura secundaria se confirmara por completo hasta 1958, cuando se resolvió la mioglobina.
shigeta
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