Creación de numeración para compendio de matemáticas en Adobe InDesign CS6

Actualmente estoy como profesor de una clase de matemáticas creando un compendio de matemáticas como complemento al libro del curso al que siento que le faltan algunas partes cruciales.

Ahora, el compendio se construye principalmente a partir de material escaneado y después de luchar con el software OCR sin mucha suerte, decidí optar principalmente por imágenes puras. Estoy usando Photoshop para trabajar las imágenes e Indesign para armar el compendio. El compendio tiene actualmente 60 páginas tamaño A4. En cuanto al diseño, las páginas consisten en diseños de una o dos columnas con información y tareas.

Lo que quiero lograr es la numeración de las diferentes tareas en mi compendio, por ejemplo, trabajar en 1000 para el capítulo 1, 2000 para el capítulo 2, etc. mal, al menos a primera vista, quizás puedas personalizarlos pero no veo cómo hacerlo.

Además, dado que las distancias entre las tareas son variables, necesitaría una forma decentemente fácil de editar la posición de los números, tal vez solo verticalmente para facilitar la edición y la adición de nuevos números. ¿Quizás se podría utilizar un sistema de posicionamiento estándar o algo similar, master layouts?.

Ahora estoy buscando formas de hacer esto decentemente rápido, ¿tiene algún consejo o consejo sobre cómo podría hacerse esto? Preguntas similares en el foro parecen indicar métodos como referencias cruzadas o puntos de anclaje, pero no puedo ver cómo implementar esos métodos aquí y, dado que no estoy familiarizado con el software, necesito su ayuda :).

Agregaré algunas imágenes reales del compendio una vez que llegue a casa del trabajo y tenga acceso, pregunte si algo no está claro.