¿Cómo puedo esperar que se vean estos humanoides?

Evolutivamente hablando, 2500 años no es mucho. Entonces tiene razón en que los cambios serían mínimos en términos de su forma humana básica. Estos cambios creo que están bien:

Blind
Underground no habría distinción entre ciegos y videntes. En nuestra sociedad, las personas con una vista cada vez peor todavía se reproducen debido a los avances en la tecnología basada en la visión (mi propia vista es terrible). En una sociedad que no necesita la vista en absoluto, incluso la ceguera total no es una desventaja, por lo que ese rasgo se transmitiría mucho más y mucho antes. Muchos niños probablemente todavía nacerían con ojos funcionales, pero estos se atrofiarían con el desuso a medida que los niños crecen, y todos los adultos quedarían ciegos en un ambiente iluminado.

Decoloración de la piel
Dependiendo de la concentración de melanina, el color de la piel puede cambiar mucho incluso en una sola vida. Una persona de piel clara que recibe muy poca luz solar tendrá una piel muy pálida; una persona con piel de color oscuro tendrá el mismo efecto, pero menos pronunciado. No es descabellado suponer que incluso los tonos de piel de color oscuro en un entorno totalmente sin luz se volverían cada vez más claros en las generaciones posteriores, especialmente si hay diferentes tonos que se cruzan.

Estos cambios creo que están mal:

Flaco
No necesariamente. La ventaja evolutiva de ser largo y delgado es que la relación entre el área de la superficie y el volumen es más alta, lo que significa que su cuerpo puede descargar el calor más rápido. Dependiendo de la geografía, esto podría ser lo contrario de lo que necesitarías para sobrevivir bajo tierra.

Las temperaturas de las cuevas varían según la ubicación y se aproximan a la temperatura media anual de la región. Las cuevas ubicadas en zonas tropicales pueden tener una temperatura constante de 35 °C/95 °F , mientras que una cueva del norte puede tener más de 10 °C/50 °F. Si su sociedad clandestina está ubicada más al norte, espere que sean bajas y robustas (para maximizar el volumen y minimizar el área de superficie).

Débil
Si tienden a ser físicamente débiles, no es por la escasez de recursos. La desnutrición puede ser un problema persistente durante algunas generaciones, pero con el tiempo la población se ajustará según los recursos disponibles. Es difícil sobrevivir como especie si siempre estás hambriento. La debilidad en una sociedad como la suya vendría de no hacer mucha actividad física.

ADVERTENCIA: Esta respuesta tiene spoilers de una película.

Probablemente se verían como las criaturas humanoides de las cavernas (llamadas rastreadores ) de la película The Descent . La película trata sobre un grupo de mujeres que va a una expedición de espeleología. Quedan atrapados en la cueva y son perseguidos por una raza de depredadores. Estas criaturas evolucionaron durante miles de años, por lo que tendrías que cambiar tu línea de tiempo.

Las características de la criatura de la cueva:

• piel pálida (despigmentación debido al ambiente oscuro)
• sin pelo (evolucionaron para tener tasas metabólicas más altas para preservar la temperatura corporal)
• ceguera/pérdida de los ojos (debido a un ambiente oscuro)
• bastante flaco (no como un esqueleto)
• comunicarse/detectar presas a través de sonidos y ecolocalización
• agudo sentido del olfato
• tener cara y orejas de murciélago
• puede escalar paredes (puedes omitir esto si quieres)
• tener una gran velocidad (más rápido que los humanos)
• tienen una gran fuerza (Quieres debilitarlos, pero en la película necesitan fuerza para cazar. Estas criaturas salen a la superficie a cazar porque lo necesitan. No hay mucho para comer en la cueva).

Aquí hay una explicación del director / escritor:

Las criaturas humanoides, a las que se hace referencia como "Crawlers" en los créditos, son, según el director Marshall...

hombres de las cavernas que nunca salieron de la cueva; evolucionaron a lo largo de miles de años, viviendo allí abajo en familias. Han perdido la vista; tienen oído y olfato agudos; y funcionan perfectamente en la oscuridad total.

Se muestra e implica en esta película, así como en la secuela, que los Crawlers, sin embargo, salen a la superficie para cazar animales como lobos, ciervos, etc., y para llevar sus cadáveres a las cuevas para comer.

https://www.imdb.com/title/tt0435625/faq

Así es como se ven en la película (tal vez puedas hacer que se vean menos horribles como en una película de terror):

También puedes consultar las características de los troglobites (especies que viven en hábitats subterráneos/cuevas).

Además de la decoloración de la piel mencionada anteriormente, es probable que sean significativamente más pequeños que sus primos de superficie dentro de unas pocas generaciones:

Los primeros estudios en animales realizados por Cowley y Greisel durante tres generaciones, y por Chow durante dos generaciones, demostraron que el estado nutricional de la rata madre tenía efectos sobre el crecimiento y desarrollo de las generaciones posteriores de ratas. Más tarde, Bresler y Zamenhof alargaron el marco de tiempo de su estudio y también ampliaron los criterios de investigación para incluir parámetros de comportamiento. En estudios que se extendieron a diez generaciones de desnutrición tanto materna como paterna, estos investigadores demostraron un crecimiento creciente y déficits de comportamiento en cada generación subsiguiente. En una serie paralela de estudios, Stewart et al informaron de manera similar un patrón de aumento de los déficits de crecimiento que involucran tanto la longitud corporal como el peso en ratas con hasta doce generaciones de desnutrición proteica moderada (8% de proteína en la dieta versus 25% para los controles). –Los efectos intergeneracionales de la adversidad temprana (Este estudio también cita varios estudios que encontraron déficits cognitivos y conductuales intergeneracionales en humanos incluso después de una generación).

La desnutrición hace que las mujeres más pequeñas den a luz a bebés atrofiados con bajo peso al nacer:

El peso al nacer está correlacionado entre generaciones y la baja estatura materna, que refleja un retraso en el crecimiento intrauterino e infantil, se asocia con bajo peso al nacer, retraso en el crecimiento infantil, complicaciones en el parto y aumento de la mortalidad infantil, incluso después de ajustar por estatus socioeconómico. – Influencias intergeneracionales en el crecimiento y la desnutrición infantil

Este informe del Comité Permanente de Nutrición de la ONU (PDF) traza un ciclo intergeneracional de "falta de crecimiento", ya que la desnutrición y el embarazo precoz (que se espera para el año 500 a. C.) conducen a bebés con bajo peso, niños subdesarrollados y mujeres más pequeñas que tienen bebés más pequeños. :