¿Cómo puedo enumerar los genes presentes en una serie determinada de bandas?

Mi pregunta está relacionada con esta . Mi interés se relaciona con esta eliminación:

del(7)(q11q36)[12]

tal como lo define ISCN .

Me gustaría acceder a una lista de los genes que se encuentran en las bandas 11 a 36 del cromosoma 7 en humanos. ¿Cómo puedo hacer eso?

Respuestas (1)

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Hay un breve tutorial aquí sobre cómo buscar por banda. Aquí hay un documento de ayuda más extenso, y aquí hay una página de ayuda específica para humanos, básicamente:

  1. Seleccione la liberación de especies y anotaciones. Somos Homo sapiens , por cierto...
  2. Seleccione el cromosoma que le interesa.
  3. En el lado izquierdo de la página, dice Region Shown:seguido de dos cuadros de entrada. Puede buscar por banda utilizando la nomenclatura citogenética estándar: 7q11y 7q36. Ingréselos en los campos de entrada y haga clic en Go. Aquí está 7q11:7q36.
  4. Hay varios enlaces para descargar datos. Quizás lo más relevante para usted es que hay un enlace a la izquierda de la página que dice Data As Table View. Aquí está dicha página, una lista de genes en varios niveles de caracterización.

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Aquí hay una tabla de diferentes consultas de búsqueda que puede usar. Hay un par de formas de analizar los datos:

Navegador de genoma interactivo:

  1. Haga clic en Genome Browser.
  2. En el campo de búsqueda, ingrese las coordenadas citogenéticas: 7q11;7q36. Presiona Go. Aquí está la página resultante.

Navegador de tablas (para descargar datos):

  1. Haga clic en Tools > Table Browser.
  2. Hay muchas opciones. Un tutorial se puede encontrar aquí . Lo más importante para su búsqueda es region. Seleccione el positionbotón de radio e ingrese sus coordenadas citogenéticas. Te dejo el resto de opciones.
¡Buena respuesta! Me gusta que hayas ofrecido directamente el pequeño tutorial y no solo los enlaces a las explicaciones. También me gusta que hayas usado el eslogan para cada recopilación de datos. Gracias
@ Remi.b De nada, espero que encuentres lo que buscas.