¿Cómo pueden las mutaciones sinónimas dar lugar a fenotipos cancerosos o tumorales?

Creo que asumiste que eso synonymous mutationsignifica silent mutation. Pero esto no es correcto.

De Wikipedia (mutación sinónima) :

Las sustituciones sinónimas y las mutaciones que afectan al ADN no codificante a menudo se consideran mutaciones silenciosas, aunque no siempre es así. Las mutaciones sinónimas pueden afectar la transcripción, el empalme, el transporte de ARNm y la traducción, cualquiera de los cuales podría alterar el fenotipo, haciendo que la mutación sinónima no sea silenciosa.

De wikipedia (Oncogen) :

El protooncogén puede convertirse en oncogén mediante una modificación relativamente pequeña de su función original. Hay tres métodos básicos de activación:

• Una mutación dentro de un protooncogén, o dentro de una región reguladora (por ejemplo, la región promotora), puede provocar un cambio en la estructura de la proteína, provocando
  • un aumento en la actividad de la proteína (enzima)
  • una pérdida de regulación
• Un aumento en la cantidad de cierta proteína (concentración de proteína), causado por
  • un aumento de la expresión de proteínas (a través de la mala regulación)
  • un aumento de la estabilidad de la proteína (ARNm), prolongando su existencia y por lo tanto su actividad en la célula
  • duplicación de genes (un tipo de anomalía cromosómica), lo que resulta en una mayor cantidad de proteína en la célula
• Una translocación cromosómica (otro tipo de anomalía cromosómica)
  • Hay 2 tipos diferentes de translocaciones cromosómicas que pueden ocurrir:
    1. eventos de translocación que reubican un protooncogén en un nuevo sitio cromosómico que conduce a una mayor expresión
    2. eventos de translocación que conducen a una fusión entre un protooncogén y un segundo gen (esto crea una proteína de fusión con mayor actividad cancerosa/oncogénica)
       • la expresión de una proteína híbrida constitutivamente activa. Este tipo de mutación en una célula madre en división en la médula ósea conduce a la leucemia en adultos.
       • El cromosoma Filadelfia es un ejemplo de este tipo de evento de translocación. Este cromosoma fue descubierto en 1960 por Peter Nowell y David Hungerford, y es una fusión de partes de ADN del cromosoma 22 y el cromosoma 9. El extremo roto del cromosoma 22 contiene el gen "BCR", que se fusiona con un fragmento del cromosoma 9. que contiene el gen "ABL1". Cuando estos dos fragmentos de cromosomas se fusionan, los genes también se fusionan creando un nuevo gen: "BCR-ABL". Este gen fusionado codifica una proteína que muestra una alta actividad de proteína tirosina quinasa (esta actividad se debe a la mitad "ABL1" de la proteína). La expresión no regulada de esta proteína activa otras proteínas que están involucradas en el ciclo celular y la división celular, lo que puede hacer que una célula crezca y se divida sin control (la célula se vuelve cancerosa). Como resultado,

Quizás te interese especialmente el segundo punto ( An increase in the amount of a certain protein)

Por lo tanto, no es nada impresionante encontrar algunas mutaciones sinónimas que estén involucradas en los oncogenes.

Este artículo aquí habla sobre cómo las mutaciones sinónimas están sobrerrepresentadas en los oncogenes y causan un empalme incorrecto del gen. http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0092867414001457#bib22

Además de eso, las mutaciones sinónimas también podrían funcionar al afectar una región reguladora como un sitio de unión del factor de transcripción, potenciadores, etc., lo que lleva a una expresión mejorada o disminuida del gen correspondiente.