Visa de larga estadía vencida; ¿Cómo puedo defenderme legalmente?

He estado revisando esta pregunta ya que tengo una situación similar.

Soy ciudadano estadounidense y durante casi un año tuve una visa de estadía prolongada tipo D para la República Checa (CR). Esta visa expiró hace casi dos meses (~60 días).

Previamente me había puesto en contacto con la embajada checa en Washington DC (dos veces para confirmar) así como con un servicio acreditado de ayuda para visas en Praga, quienes me aseguraron que podía permanecer legalmente en la República Checa por hasta 90 días como turista después de mi visa de larga estadía venció. Esto se debió, por supuesto, a mi permiso de exención de visa de 90 días como ciudadano estadounidense. Sobre esta base, he permanecido en CR hasta ahora y tengo todas las razones para creer que lo estoy haciendo legalmente.

Además, después de haber visitado este sitio, me enteré del Reglamento (UE) 2016/399 sobre la ley 90/180 Schengen sin visado (o de corta estancia). Del artículo 6:

"2. [...] Los períodos de estancia autorizados en virtud de un permiso de residencia o un visado de larga duración no se tendrán en cuenta en el cálculo de la duración de la estancia en el territorio de los Estados miembros."

Sin embargo, también hablé con el personal consular de las embajadas alemana y húngara (ambas en DC) que me dijeron que el tiempo que pase en la zona Schengen mientras mi visa de estadía prolongada estaba activa, incluso en el país que la otorgó, contaría en contra mi permiso libre de visa de 90 días.

Cuando pedí una aclaración, el miembro del personal alemán me dijo que, en general, se trataba de una "zona gris", pero que los agentes fronterizos aplicarían la ley tal como él la describió. En cambio, el personal consular de la embajada húngara me dirigió al Reglamento de la UE n.º 265/2010 , citando lo siguiente del código de fronteras Schengen:

"Los extranjeros que sean titulares de un permiso de residencia válido expedido por uno de los Estados miembros podrán, sobre la base de dicho permiso y de un documento de viaje válido, circular libremente durante un máximo de tres meses en cualquier período de seis meses dentro del territorio de los demás Estados miembros, siempre que cumplan las condiciones de entrada a que se refiere el artículo 5, apartado 1, letras a), c) y e) […]».

Al leer esta ley, no parece decir nada específicamente sobre el tiempo pasado en una visa de estadía prolongada que cuenta contra mi permiso de viaje sin visa, por lo que no estoy seguro de cuál era la intención. El oficial puso la palabra "válida" en negrita en el correo electrónico, pero esto todavía no dice nada de mis 90 días sin visa. Independientemente, la regulación de 2016 vinculada anteriormente aborda específicamente esto.

Entonces, parecería que las embajadas de Alemania y Hungría están equivocadas, o al menos creen que sus agentes fronterizos son libres de interpretar/desobedecer la ley como lo deseen. Sin embargo, esto es muy alarmante, ya que su capacidad para estar mal informados puede extenderse a los oficiales de inmigración en los puntos de partida. Mi última entrada sellada en la zona Schengen se registró en Alemania en agosto pasado después de un viaje al Reino Unido, pero, naturalmente, regresé a la República Checa poco después, ya que era allí donde vivía.

Sería bueno pensar que, si se examina, puedo referirme a la regulación de 2016 para demostrar que estoy dentro del alcance de la ley. Sin embargo, incluso si estoy preparado con esta información, ahora me preocupa que un oficial equivocado pueda sancionarme y exigir que pelee en los tribunales. Preferiría en gran medida no pasar por el dolor de perder un vuelo seguido de un caso legal para que se anulen mis multas incurridas indebidamente. También sería extremadamente perjudicial para mi carrera si no puedo regresar fácilmente a la UE/Zona Schengen en el futuro.

Asimismo, será difícil encontrar un vuelo asequible desde CR que no transite por otra nación europea. Preferiría no tener que traer un abogado conmigo cuando me vaya (si esto ayudara). Solo me quedan ~30 días sin visa, así que tendré que partir pronto.

Me pregunto primero si alguien tiene una idea de por qué estas embajadas me darían esta información aparentemente errónea. En segundo lugar, ¿alguien ha tenido un problema en la frontera como este en el que hayan presentado su caso con éxito? ¿Qué recomendaría que esté preparado para hacer/decir cuando me vaya para protegerme contra una sanción injusta?