Transcripción de ADN a ARNm con intrones

Tengo un problema en mi clase de bioinformática que pensé que estaba haciendo bien, pero alguien más está obteniendo una respuesta diferente. Aquí está el problema:

Dada la siguiente secuencia de ADN, 5'-GGATCGTGCCACCATCCACCATCGTTA-3', si dos intrones están en las bases 3-9 y 15-22, ¿cuál es el ARNm transcrito? Dé la respuesta de 5' a 3'. Tenga en cuenta que la primera base es la base 1.

Y aquí están los pasos que tomé:

  1. 5'-GG ATCGTGC CACCA TCCACCAT CGTTA-3' (quitar lo que está en negrita)
  2. 5'-GGCACCACGTTA-3' (cadena nueva)
  3. tomar complemento inverso
  4. intercambiar T con U

¿Es esto correcto? ¿O dónde me estoy equivocando?

Si mira en ensembl.org, que usan los biólogos reales, la secuencia de ADN dada para un gen y la secuencia de ADN dada para una transcripción son las mismas, si el gen se ejecuta en la dirección de avance. No tienen compensación de revoluciones; la gente ni siquiera sustituye las U en las secuencias. Así que tenga en cuenta que parte de lo que está haciendo es solo para demostrar que realmente sabe que el ARN tiene U, que hay una diferencia entre la plantilla y las hebras de codificación... los biólogos reales lo dan por sentado.

Respuestas (1)

Creo que el único lugar en el que te equivocas es en confundirte con las hebras ("tomar el complemento inverso").

5'-GGATCGTGCCACCATCCACCATCGTTA-3'   << coding strand
3'-CCTAGCACGGTGGTAGGTGGTAGCAAT-5'   << template strand

La hebra codificante tiene la misma secuencia que el ARN transcrito (aparte de T>U), por lo que la transcripción primaria es:

5'-GGAUCGUGCCACCAUCCACCAUCGUUA

Luego, las posiciones de los intrones:

5'-GG AUCGUGC CACCA UCCACCAU CGUUA

y después del empalme:

5'-GGCACCACGUUA
¿Se toma el complemento inverso después del empalme? Parece que obtuvimos el mismo resultado, solo tomé el complemento inverso y volteé las T a la última U
No necesita tomar el complemento inverso: la cadena 'superior' del ADN (es decir, la secuencia en su pregunta) es la misma secuencia que el ARN, porque el ARN se fabrica utilizando la cadena complementaria como plantilla. Incluí el hilo 'inferior' para mayor claridad.
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