¿Son Barry Allen y Bruce Wayne de Universos diferentes?

Estás haciendo tantas suposiciones aquí. Para dejar claro que hay dos universos principales.

El Arrowverse , que consta de los programas de televisión Arrow , The Flash , Legends of Tomorrow , Vixen y Supergirl (Supergirl existe en una Tierra diferente (Tierra - 38) que Flash, pero sigue siendo canon para Arrowverse). Constantine existe en la misma tierra que Flash y Arrow.

Pero el movieverse es diferente y se llama DC Extended Universe , que consiste en Man of Steel , Batman v Superman: Dawn of Justice , Suicide Squad , Wonder Woman por ahora y Justice League vendrá después. En DCEU no se menciona a Supergirl o Arrow y allí Barry Allen es una interpretación diferente del mismo personaje de cómic.

Aquí hay palabras oficiales sobre este enfoque de mantener los programas de televisión y las películas separados entre sí:

En octubre de 2014, Warner Bros. anunció los títulos y las fechas de estreno de nueve películas, junto con información sobre el reparto. También en el mes, el director creativo de DC Comics, Geoff Johns, explicó la diferencia de DC en el enfoque de Marvel Studios y su universo cinematográfico, diciendo: "Lo vemos como el multiverso. Tenemos nuestro universo televisivo y nuestro universo cinematográfico, pero todos ellos coexistir. Para nosotros, creativamente, se trata de permitir que todos hagan el mejor producto posible, cuenten la mejor historia, hagan el mejor mundo. Todos tienen una visión y realmente quieres dejar que las visiones brillen... Es solo un enfoque diferente - Wikipeida

Incluso la temporada 2 de Supergirl tendrá su propia versión de Superman.

Entonces, no hay dos líneas de tiempo en conflicto, sino dos universos o cánones completamente diferentes.

Consulte aquí el blog que explica DC Cinematic Multiverse.

En la nota al margen, Arrowverse mencionó a Superman/Batman y otros superhéroes de DC de la Liga de la Justicia de vez en cuando. Como Barry, tiene a Diana (Wonder Woman), Hal (Green Lantern) y Bruce en su marcación rápida en la tierra 2

Y mencionaron tener a Aquaman en Earth 2. Y Earth one Legends of Tomorrow mencionó a Superman y Batman en un diálogo .

"He visto morir a hombres de acero y caer caballeros oscuros.

Pero esos son todos huevos de Pascua sin apariencia real. Pero Legends of Tomorrow S02 tendrá su propia versión de Justice Society of America

Lo interesante de la segunda temporada es que creo que tendrá un tono muy, muy diferente porque nuestras Leyendas tendrán un propósito totalmente diferente. En realidad van a tener una constitución totalmente diferente. Habrá caras nuevas y todo nuevo". La temporada también presentará a los miembros de la Sociedad de la Justicia de América. La Sociedad estará compuesta por Vixen, Commander Steel, Obsidian, Stargirl y Dr. Mid-Nite. La temporada también contará con una versión de Legion of Doom, compuesta por Reverse Flash, Malcolm Merlyn, Damien Darhk y Captain Cold - Wikipedia

Pero no tiene nada que ver con las películas, ya que son entidades separadas por ahora. También hay un programa de televisión Gotham , centrado en la ciudad de Gotham, pero que no tiene nada que ver con ningún otro programa de televisión o película todavía y funciona individualmente.

Está sutilmente implícito que existen de alguna forma, en algún lugar.

Por ejemplo, en The Flash , el "futuro periódico" de Wells contenía un artículo sobre una fusión entre Queen Consolidated y Wayne Industries. Y en Legends of Tomorrow , Rip Hunter insinúa (sin decirlo realmente) que la razón por la que Superman y Batman no están presentes es porque Vandal Savage los derrotó (y presumiblemente los mató) a ambos.

¡He visto morir a hombres de acero y caer caballeros oscuros! Su mundo entero del siglo XXI sufrirá.

Hay una versión de Batman que existe en Gotham City of Arrow/Flash Earth 1.

En algún lugar de los primeros episodios de la primera temporada, cuando Barry está hablando con Arrow, mencionan a Batman, no por su nombre iirc, en Gotham City.