Hay toneladas de tierra, rocas, etc. que se extraen, cavan y mueven en todo el mundo todos los días. Los paleontólogos también excavan regularmente fósiles y especímenes enterrados y congelados, y los biólogos toman muestras de permafrost, suelo y cuerpos de agua subterráneos.
Dada toda la agitación de estos sustratos y especímenes antiguos y subterráneos, me pregunto cuáles son las probabilidades de que desenterremos una superbacteria.
Entiendo que es probable que esta sea una pregunta demasiado amplia para responderla aquí (¡pero siéntase libre de intentarlo!), por lo que la dividiré en un conjunto de preguntas más relevantes para informar mi investigación.
¿Cuántos microbios (# de especies y/o densidad) existen típicamente en un metro cúbico de suelo? (o algún otro volumen)
¿Estas abundancias y diversidad de microbios cambian con la profundidad?
¿Cuál es el lugar más profundo de la corteza que se ha encontrado que alberga vida?
What is the deepest place in the crust that has been found to harbor life?
El animal vivo más profundo :
Halicephalobus mephisto es diminuto (solo 0,5 mm de largo) y representa el organismo multicelular más profundo jamás encontrado.
El documento original se puede encontrar aquí: Borgonie et al. (2011)
Do these microbe abundances and diversity change with depth?
Según Inagaki et al (2015) , la densidad de microbios es muy baja a bajas profundidades:
Al contar las células de estos microbios, también concluyen que se trata de una comunidad pequeña, con solo una célula por centímetro cúbico de sedimento en algunas secciones del sedimento.
Es una pregunta interesante y espero que esta respuesta no parezca frívola, porque esa no es mi intención. En mi opinión, las probabilidades de encontrar un microorganismo que nunca se haya encontrado con humanos (o cualquier mamífero) pero que haya desarrollado la capacidad de infectarlos parecen bastante bajas. Para que un organismo sea patógeno, debe tener los medios para evadir el sistema inmunitario del huésped. Este es un rasgo adaptativo que requiere coevolución con el anfitrión. Puede encontrar una discusión de libro de texto sobre patógenos en Molecular Biology of the Cell . Es importante destacar que hay una sección titulada Los patógenos han desarrollado mecanismos específicos para interactuar con sus anfitriones que responde bastante bien a su pregunta:
En contraste [con la flora microbiana normal], los patógenos dedicados no requieren que el huésped esté inmunocomprometido o lesionado [para causar una infección]. Han desarrollado mecanismos altamente especializados para atravesar barreras celulares y bioquímicas y para provocar respuestas específicas del organismo huésped que contribuyen a la supervivencia y multiplicación del patógeno.
Para sobrevivir y multiplicarse en un huésped, un patógeno exitoso debe ser capaz de: (1) colonizar el huésped; (2) encontrar un nicho nutricionalmente compatible en el cuerpo huésped; (3) evitar, subvertir o eludir las respuestas inmunitarias innatas y adaptativas del huésped; (4) replicar, utilizando recursos del host; y (5) salir y propagarse a un nuevo huésped. Bajo una severa presión selectiva para inducir solo las respuestas correctas de la célula huésped para lograr este complejo conjunto de tareas, los patógenos han desarrollado mecanismos que explotan al máximo la biología de sus organismos huéspedes.
También hay que tener en cuenta que la aparición de superbacterias se debe a la intensa presión selectiva por el uso de antibióticos. Tal escenario no es aplicable a organismos que nunca hemos encontrado antes.