Me gustaría preguntar si existe algún método (establecido o no) para cuantificar la heterogeneidad que se encuentra en las mutaciones que ocurren en las neoplasias primarias y las lesiones metastásicas (ya sean comunes o privadas) y potencialmente correlacionar este número con los rasgos clinicopatológicos estándar.
Los métodos que vienen inmediatamente a la mente están relacionados en su mayoría con la secuenciación de próxima generación . Puede hacer una secuenciación profunda en su muestra, lo que simplemente aumenta la cobertura tanto como sea posible para encontrar eventos raros. Puede hacer RNA-seq para ver el transcriptoma, ChIP-seq para ver las modificaciones de la cromatina y la secuenciación de una sola célula (una forma de secuenciación profunda que opera en células individuales) para obtener datos verdaderamente célula por célula, ya sea desde el genoma (ADN) o transcriptoma (ARN).
Si solo busca fenotipos, la citometría de flujo es bastante útil para analizar los niveles de expresión relativa de proteínas, utilizando marcadores y tinciones extracelulares e intracelulares. FACS es una extensión de la citometría de flujo que permite la clasificación de varias poblaciones de células en contenedores separados. Estas muestras "purificadas" se pueden usar en cualquiera de los métodos enumerados anteriormente.
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