Hay una extensa literatura sobre codones sinónimos y su uso en diferentes organismos. Asumiré que la pregunta se refiere a la relación entre la fuerza de la interacción codón-anticodón y la eficiencia (velocidad en este caso) de la traducción.
- No se discute (soy consciente de algunos experimentos sobre esto) que la fuerza de la interacción codón-anticodón depende de la cantidad de enlaces de hidrógeno formados.
- Se predijo que para una tasa óptima de traducción se necesita un equilibrio entre la asociación y la disociación del par codón-anticodón. Por lo tanto, las interacciones débiles (todas AU), que desfavorecerían la asociación, o las interacciones fuertes (todas GC), que desfavorecerían la disociación, no permitirían una tasa de síntesis de proteínas tan rápida como la de las interacciones intermedias (AU mixto, GC).
- Esto pareció confirmarse en los patrones de uso de codones de organismos de crecimiento rápido como Escherichia coli , algo que posteriormente fue confirmado por estudios más amplios . Para ser precisos, las proteínas más altamente expresadas (p. ej., proteínas ribosómicas) fueron codificadas por ARNm que contenían las interacciones codón-anticodón intermedias previstas para permitir una traducción rápida. Por el contrario, las proteínas pobremente expresadas (por ejemplo, represores) fueron codificadas por mis ARNm que se predijo que producirían una traducción más lenta.
- Sin embargo, se debe tener en cuenta que existen otros factores que influyen en el uso de codones en diferentes organismos, y que estos pueden anular el efecto de la fuerza de interacción codón-anticodón.
David
David