Algunas ambigüedades básicas que me confunden. Descargué secuencias de 5'UTR, CDS, 3'UTR y exón, por separado de Biomart para un gen P4HA2 (Homo sapiens) y encontré algunas repeticiones de secuencia simple (SSR) en ellas. Si bien hay una x repetida en la secuencia del exón, no estaba ubicada en la 5'UTR, la 3'UTR y la secuencia de codificación (o CDS) del gen. Como recuerdo, la secuencia de exones es la misma que la secuencia de codificación, excepto por el primer y el último exón, que son partes de 5'UTR y 3'UTR, respectivamente, ¿verdad? ¿Podría por favor ayudarme a encontrar cómo es posible el evento mencionado? Gracias
Como recuerdo, la secuencia de exones es la misma que la secuencia de codificación, excepto por el primer y el último exón, que son partes de 5'UTR y 3'UTR, respectivamente, ¿verdad?
No necesariamente. Las UTR pueden estar compuestas por múltiples exones y puede haber un exón que abarque ambos lados del codón de inicio, es decir, es parte tanto de la 5'UTR como de la CDS. De manera similar, un exón puede abarcar ambos lados del codón de parada.
Una razón por la que no puede asignar su repetición a ninguna de las regiones del ARNm podría ser que su repetición se encuentra en un exón que abarca el codón de inicio/finalización. La repetición en sí podría abarcar estos sitios. Debe proporcionar detalles adicionales, como la ubicación de la repetición, el tamaño de la repetición y el exón al que se asigna. Mencione también qué archivo de genoma de referencia está utilizando.
La región codificante es aquella región de la hebra codificante de ADN que se traduce en un producto. Esto es sinónimo de la región del exón. La región no traducida 5' y la región no traducida 3' son solo eso y, aunque pueden tener una función poco conocida en la replicación, no se traducen en una proteína. "región de codificación" no es un término que haya escuchado ampliamente, aunque soy un neófito como biólogo molecular.
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