¿Dónde encontrar datos de expresión génica de E.coli?

Estoy buscando datos de expresión del genoma completo de E.coli con diferentes condiciones, se agradece cualquier sugerencia. La condición podría ser, por ejemplo, una temperatura de crecimiento diferente, medios diferentes, etc. Probé GEO pero solo da una lista y uno debe leer todas las páginas y muestras una por una para ver qué condiciones se usaron.

¿A qué te refieres con "condición diferente"? GEO es una base de datos que contiene datos de expresión génica, por lo que no es el lugar para buscar genomas completos. Si busca datos de expresión génica, adapte su pregunta. Puede encontrar información sobre diferentes genomas completos de E.coli aquí
@Chris modifiqué mi pregunta
¿Está buscando algo que le proporcione una lista de los genes que se expresan en condiciones específicas?
puede ejecutar una consulta GEO automatizada y obtener números de acceso GEO para aquellos que coincidan con sus palabras clave.
Si está interesado en la secuenciación de datos, busque NCBI-SRA
@WYSIWYG, ¿puede darme un ejemplo de cómo ejecutarlo y cómo obtenerlos?
@Nemo ver aquí . Tienes que construir una búsqueda basada en tus palabras clave y mencionar la base de datos. Luego, debe extraer la lista de información recuperada para seleccionar cuáles realmente necesita. A continuación, puede descargar los datos correspondientes a estos experimentos de forma similar. Vea esto también. Si tiene dudas específicas sobre esto, publíquelas como nuevas preguntas.

Respuestas (1)

Hay algunas bases de datos en las que puede buscar datos de expresión génica de E.coli :

Para conocer el propósito y las condiciones de los experimentos detrás de estos conjuntos de datos, deberá leer las publicaciones respectivas.

¿Puede publicar algunos documentos de ejemplo realizados para los datos de expresión génica de E coli si conoce alguno?
¿Dónde encontrar datos de expresión génica de E.coli?
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