Me pregunto cuál es la diferencia en los datos alojados aquí:
También (nota al margen), estaría interesado en notar cuál es la diferencia entre ftp-tracey solo ftp. Pero probablemente haya más de 1 TB de datos en /genomes, y asumo que hay algo de "mil genomas" /1000genomes, pero no estoy seguro de qué datos exactamente. Me gustaría saber qué son estas dos carpetas y dónde están exactamente los datos de 1000genomes. Parece que /1000genomes/ftp/data/ tiene "datos de secuencia", pero no estoy seguro de cómo se compara con la /genomeslista de nombres de especies (y tampoco estoy seguro de qué implica exactamente "datos de secuencia").
La diferencia más simple es la escala y el rango. El objetivo del proyecto 1000 genoma era proporcionar una biblioteca completa de la variación genética humana . Se secuenció ADN de individuos provenientes de diferentes etnias, ubicaciones geográficas y los resultados del estudio se publicaron aquí .
Los genomas del NCBI provienen de diferentes organismos y el número de individuos secuenciados difiere entre especies (incluida la humana). Esta base de datos está en constante crecimiento. La descripción detallada se puede encontrar aquí .
De hecho, estas dos cosas son muy diferentes y yo diría que todo lo contrario.
Los genomas NCBI son una colección de información sobre genomas de varias especies, incluidas secuencias, mapas, cromosomas, ensamblajes y anotaciones. Básicamente es un catálogo de genomas de referencia.
1KG es un catálogo de variaciones genéticas humanas de un estudio de asociación de todo el genoma.