¿Cuándo será tan simple jugar con la biología como lo es ahora la programación?

La biotecnología es una gran palabra clave en la industria en este momento, como lo fue la informática hace un montón de años. Hoy en día, cualquiera puede abrir una terminal y comenzar a jugar con su computadora, programar software, hacer realidad cualquier cosa de su imaginación en el mundo virtual. Se puede observar una tendencia similar con los objetos y el crecimiento de los laboratorios de fabricación en todo el mundo.

¿Pasará esto con la biología y cuándo? ¿En qué momento de nuestro futuro cercano veremos a los niños jugar con moléculas, ADN y vida?

Esta pregunta NO pretende abarcar lo que podría resultar en tales retoques.

¿Podría aclarar qué quiere decir con "jugar con moléculas, ADN y vida?" Hay varios significados diferentes, que abordaría de manera muy diferente. Hay una gran diferencia entre "regular a la baja la producción de melanina en mis ojos para cambiarlos de marrón a verde por un tiempo" a "hacer que mis ojos sean verdes permanentemente" a "cambiar mis óvulos/espermatozoides para que todos mis futuros hijos tengan ojos verdes" a " Diseñe una nueva proteína desde cero que haga ojos morados sin efectos secundarios no deseados". Algo de esto ya se puede hacer, otros son un verdadero desafío.
Supongo que quise decir todo esto. No lo había pensado demasiado lejos. Buenos ejemplos de lo que tenía en mente se mencionaron aquí: worldbuilding.stackexchange.com/a/4443/90 . Pero me interesaría una línea de tiempo para todo lo que mencionaste básicamente :-)
Esto se siente relacionado: mitadmissions.org/blogs/entry/…

Respuestas (5)

Aunque mi respuesta seguramente se basa en opiniones, creo que la respuesta es: probablemente nunca. La razón es que si desea comparar el código genético humano y animal con un código de computadora, parecería 0 % de lógica y estructura y cientos de millones de años de depuración. Así funciona la evolución: se crean mutaciones aleatorias y, si sirven, se propagan. La programación de computadoras también se puede hacer de esta manera con el uso de algoritmos genéticos . Los resultados son a menudo efectivos, pero completamente incomprensibles para los humanos.

Ya hoy podemos insertar casi cualquier ADN que deseemos en una célula. Uno podría escribir el ADN como una larga serie de letras y seríamos capaces de sintetizarlo. El problema no está en la tecnología, sino que no sabemos qué hará. Dado que es tan difícil entender el código del ADN, los cambios finos probablemente siempre requerirán una gran cantidad de investigación y experimentos. El código es demasiado complicado para cambiarlo tan simplemente.

Si todos los animales están "muy mal escritos", podríamos preguntarnos qué tan cerca estamos de escribir animales desde cero. También parece muy, muy problemático. A diferencia de la vida, nuestro software es muy jerárquico. El nivel más alto de programación se basa en la traducción precisa a instrucciones de procesador similares a las de un ensamblador, que se basan en procesadores que realizan muchas tareas simples con mucha precisión. Incluso el procesador es básicamente una parte simple, un transistor, copiado muchas veces en una estructura muy precisa. Cada nivel funciona perfectamente y se puede separar completamente del siguiente. Esto nos permite entenderlo y escribir software de manera eficiente. Las unidades básicas de vida, las proteínas, son mucho más desordenadas. De ninguna manera funcionan tan limpiamente como los transistores y probablemente se necesiten muchas más pruebas y errores para persuadir a toda la maquinaria de las proteínas para que funcione según lo previsto. cooperando con otras proteínas. Mi estimación es que todavía podríamos necesitar cientos de años para encontrar una forma de evitarlo.

No estoy de acuerdo. Sí, es complicado, pero es un bloque de código finito, por lo que eventualmente deberíamos poder descifrarlo y comprenderlo. Además, si desea escribir organismos completamente nuevos, solo necesita comprender lo suficiente del código original para no matar la célula en la que está inyectando el código, y comprender los principios lo suficientemente bien como para construir su nuevo código. El hecho de que los únicos programas disponibles sean terribles trucos no significa que no puedas escribir nuevos programas que no lo sean.
Estoy de acuerdo en que seremos capaces de comprender los problemas seleccionados y cualquier cambio previsto probablemente podría realizarse con los recursos y el tiempo suficientes. Estaba respondiendo a la pregunta "¿Qué tan pronto será tan simple como programar jugar con la biología?". A esto, digo probablemente nunca: ya que el código fuente de animales y humanos está muy mal escrito. No es un problema de tecnología, sino que cada cambio presentará un nuevo desafío para ser descifrado. También amplié un poco mi respuesta para abordar la cuestión de escribir la vida desde cero que planteaste.
Empiezo a preguntarme si tal vez subestimas la programación. Jugar directamente con los genomas se trata del nivel de programación de ensamblaje; Ciertamente, esperaría que los expertos en biotecnología avanzados tuvieran herramientas similares a nuestros compiladores, con datos programados sobre el funcionamiento interno de los organismos a los que se dirigen. Y definitivamente subestimas la complejidad de los procesadores. Estoy bastante seguro de que no hay una sola persona que entienda un procesador actual a nivel de transistor (¡y en esas dimensiones, saber qué transistor se conecta a qué otro está lejos de ser suficiente para caracterizar la funcionalidad!)
De lo que está hablando no es de "programación de ensamblaje" sino de "desensamblaje". Estás hablando de tomar el código de espagueti construido durante millones de años e intentar separar qué secciones forman una mano y qué secciones forman un pie. En realidad, esas divisiones son mucho más confusas. Si habla con alguien que trabaja en ensamblaje, el primer paso es que DEBE comprender qué convenciones usaron, o el ensamblaje será ilegible. La naturaleza no utiliza convenciones, hasta donde hemos podido descifrar.
Estoy tratando de señalar que tener compiladores requiere el nivel subyacente de ensamblador para funcionar sin problemas de acuerdo con un pequeño conjunto de reglas. Sin esto, ¿cómo funcionaría el compilador? Los procesadores son increíblemente complejos, sin duda. Sin embargo, se basan fuertemente en unas pocas reglas simples, lo que no creo que sea el caso de los sistemas biológicos. Esta estructura permite una fácil comprensión y facilita el trabajo. Estas ideas provienen principalmente del excelente libro The Pattern on the Stone de W. Daniel Hillis , que realmente puedo recomendar sobre este tema.
@CortAmmon Por lo que tengo entendido, la naturaleza tiene algunas convenciones que hemos podido descifrar, como los reguladores de genes. Y las bases han evolucionado hacia una codificación común de las muchas posibles (lo que nos ha permitido crear codificaciones de bases artificiales). Esto sugeriría que Nature prefiere la interoperabilidad tanto como nosotros. Lo que significa que hay un conjunto pequeño y finito de instrucciones de máquina que puede cubrir toda la vida.
@Black: Eso es cierto. En el nivel más bajo de ADN, la naturaleza mantiene un conjunto simple de instrucciones de máquina. Sin embargo, el uso de estas sencillas instrucciones es cualquier cosa menos simple. El proteoma es donde el caucho golpea el camino, y apenas estamos haciendo avances allí.
Dado que esta pregunta es sobre tecnología futura, ¿cómo cambiaría esta respuesta si pudiéramos producir secuencias completas de ARN/ADN en milisegundos y sin costo de recursos? ¿Quizás con una simulación por computadora lo suficientemente avanzada que pueda dar resultados al instante? Los bioingenieros del futuro podrían "evolucionar" sus propios organismos modelo desde cero sin utilizar las secuencias existentes, utilizar la IA para descubrir secuencias que crean proteínas y estructuras celulares específicas, eventualmente diseñar organismos multicelulares y luego diseñar sus órganos y extremidades, teniendo en cada punto un objetivo claro. comprensión de qué gen hace qué.

La pregunta es realmente difícil de responder, debido a la controversia sobre las células madre en la que las personas religiosas se oponen al uso de embriones humanos con fines científicos.

A pesar de que omitió pensar en los resultados finales de que todos puedan jugar con organismos vivos, la difusión real se basará en "qué posibilidades nos brinda esto".

Por ejemplo, si bien es cierto que puede comprar una computadora y escribir su primer programa Hello World , en el caso de "ciencias de laboratorio" todavía es suficiente para permitirle hacer un pequeño juego de laboratorio para descubrir células de flores y si tiene ganas quieres saber más, hay una escuela especializada para que aprendas eso.

Además, la computadora en todos los hogares aparece porque resuelve más de un problema del "hogar general" (mientras que "jugar" podría ser uno de ellos).

Para resumir, incluso si el público en general está apoyando fuertemente el retoque del ADN, sigo creyendo que el dispositivo para jugar con el ADN será más parte del "laboratorio de la escuela secundaria" que del hogar común. (Por lo tanto, nunca llegará a los hogares comunes).

Para adivinar el tiempo, creo que un horizonte plausible para pensar es de 20 a 50 años.

Pero tenga en cuenta que no importa cuán genial pueda sonar el dispositivo o la tecnología en el papel, siempre el público en general puede estar en contra .

Creo que la primera oración (y la última oración) resumen el argumento perfectamente, aunque me gustaría ver la perspectiva de una persona religiosa conservadora sobre el asunto.
Una vez tuve una discusión con una persona religiosa al respecto e intentaré resumir los argumentos: 1) Dios es el creador de toda vida 2) Solo Dios puede quitar la vida 3) El embrión es vida, por lo tanto, no se le permite "mátalo" ya que no eres Dios
Supuse que sería algo así. (Suspiro)
La bioingeniería cumple un propósito doméstico común. Puede alimentar a sus cultivos de bioingeniería con algunos materiales baratos (o incluso restos de comida/reciclables) y producir otros materiales útiles. Esto puede incluir medicamentos, alimentos, fragancias, plástico para impresoras 3D, cualquier cosa que pueda sintetizarse en un laboratorio. La gente compraría "impresoras de bacterias", descargaría especies de Internet de la misma manera que descargamos modelos para impresoras 3D y las usamos para cualquier cosa. No se trata de 20-50 años de lo que predice, pero las computadoras también necesitaron mucho tiempo para llegar a todos los hogares. Comería mucho más yogur si tuviera esa tecnología.

No pasará mucho tiempo antes de que elijamos usar el poder del ADN y la biología para ayudarnos a hacer cálculos (actualmente existen computadoras basadas en ADN). Sin embargo, pasará MUCHO tiempo antes de que nos sintamos cómodos jugando con la biología existente porque el "código fuente" es demasiado difícil de entender.

Hemos estado evolucionando durante millones de años. La "legibilidad del genoma" nunca ha sido seleccionada (de hecho, podría incluso haber sido seleccionada en contra). Todo el código humano escrito ha tenido la "legibilidad" como una preocupación principal, por lo que diseñamos nuestros productos de manera diferente. Por ejemplo, hay un meme en la programación "se considera dañino", porque hace que las cosas sean difíciles de leer. También hay una filosofía para minimizar las interacciones de subprocesos porque son difíciles de seguir. El producto de la naturaleza usa "goto" en todas partes, y la mejor analogía para el comportamiento celular involucraría millones de hilos que interactúan. Muchas de nuestras formas y características peculiares son en realidad el resultado de un "código compartido" que mutó para ser beneficioso para un propósito completamente diferente.

Me gusta creer que tendremos algún poder sobre la biología en algún momento del futuro de nuestra raza. Sin embargo, no creo que el poder tenga un gran parecido con la programación de hoy. Espero que se vea mucho más sutil.

La tecnología de ingeniería genética ya nos permite manipular los genomas de varios organismos modelo con extrema precisión. La recombinación homóloga en levadura permite a los investigadores cambiar virtualmente cualquier secuencia en el genoma a lo que quieran, y ahora el sistema CRISPR/Cas9 que se está desarrollando muestra una enorme promesa para su uso en organismos multicelulares más complicados. La investigación genética actual implica comúnmente la eliminación de secuencias de ADN, la inserción de secuencias de ADN, la fusión de genes y, en realidad, cualquier cosa que pueda imaginarse haciéndole a una secuencia genética para descubrir cómo funciona. Eso no quiere decir que sea fácil. Hay protocolos precisos que consumen mucho tiempo que deben seguirse y que no siempre funcionan. Se necesitan los recursos de un laboratorio moderno, una buena cantidad de dinero y mucha experiencia. Para que un niño pueda hacerlo, todo el proceso debería ser automatizado por una máquina. Algunos laboratorios extremadamente bien financiados tienen robótica que es capaz de automatizar algunos procesos, pero estamos muy lejos de algún tipo de dispositivo personal de ingeniería genética todo en uno.

Si bien puede ser posible en el futuro manipular rápida y económicamente el genoma de un organismo, la barrera más grande para hacer algo que realmente quieres es saber qué cambiar. Realmente no entendemos el propósito de la mayor parte del ADN en nuestros genomas. Nuestra investigación actual generalmente implica romper algo, ver qué sucede y luego generar un modelo de lo que estaba haciendo esa cosa. Estamos muy lejos de poder hacer cambios intencionados para generar organismos personalizados.

En mi opinión, es probable que la revolución biotecnológica que imaginas deba ser precedida por una revolución informática. Para obtener realmente un modelo completo de cómo funcionan los genomas, necesitamos modelos computacionales potentes para la predicción de la función y la estructura de las proteínas, así como para simular todas las redes reguladoras interconectadas que rigen todas estas proteínas.

100.000 años a partir de ahora? ¿Dentro de 1.000.000.000 de años? ¿Nunca?

Hay muchos argumentos en contra de que esto suceda, e incluso más argumentos de por qué esto nunca sucederá en el corto plazo, a menos que invoquemos la fantasía científica y también los rápidos movimientos hacia mejoras sociales utópicas al ritmo de, digamos, la línea de tiempo de Star Trek . AFAIK Star Trek no tiene este nivel de tecnología (ni de confianza infantil).

Considerar:

  • Jugar con tu cuerpo es peligroso , así que hasta que ya menos que también tengamos tecnología de resurrección, sería irresponsable invitar al público en general a jugar con la manipulación genética.

  • La manipulación genética es peligrosa para toda la vidaespecialmente porque para cambiar el ADN de un organismo de manera sistemática, se necesita un poderoso mecanismo de propagación, y el ADN también muta naturalmente. Es por eso que es una muy mala idea permitir que las corporaciones con fines de lucro realmente liberen cultivos transgénicos, y mucho menos que los alimenten a todos, y que no los etiqueten. Por ejemplo, las plantas OGM esparcen sus semillas en el medio ambiente donde terminan extendiéndose a otros campos y corrompiéndolas en plantas OGM y nuevas variedades OGM, reduciendo las plantas no OGM. Cuando estas empresas también diseñan intencionalmente cultivos alimentarios para que no puedan generar semillas, para contener niveles masivos de pesticidas, etc., solo están pidiendo que algo salga mal, potencialmente irreversible. Dejar que Junior se meta con el ADN es una mala idea, y tu futura sociedad lo va a pasar mal.

  • La analogía de que el ADN es como un código de programa es más teórica y metafórica que literal y práctica. Jugar con el ADN en las semillas hasta obtener algunos efectos positivos es el equivalente de programación de jugar aleatoriamente con el código de máquina de otra persona, así:ingrese la descripción de la imagen aquíExcepto que ESO es un programa muy conciso, escrito lógicamente y pequeño, así que algo con una gran cantidad de páginas de eso, y escrito al azar por naturaleza, con la mayor parte del código aparentemente sin hacer nada pero posiblemente haciendo algo, y sin ejecución lineal, ya que algunos de esto puede ser la parte (o parte de una parte de una parte de un sistema) que comienza a hacer que el vello de la barbilla de George Lemuelson se vuelva gris a los 48 años mientras reduce su libido en un 5 % y aumenta su probabilidad de desarrollar diabetes tipo A en un 5 %. . Y solo puedes cortarlo y pegarlo en trozos, intercambiando trozos de otras versiones del mismo programa. Su única esperanza es que los fragmentos que tiene que cortar y pegar provengan de otros programas que han sido diseñados para ser cortados, pegados y recombinados. Pero desafortunadamente, muchas de estas combinaciones pueden ser infértiles, letales o cancerosas. Es por eso que GMO se hace en laboratorios donde puede desechar casi todas sus muchas fallas. Lo cual no quieres que Junior haga por sí mismo, a menos que quieras que muera.

No estoy de acuerdo con su punto de que "la manipulación genética es peligrosa para toda la vida". Las bacterias y los virus mutan todo el tiempo en la naturaleza y solo unos pocos de ellos son realmente mortales. Y ellos son aquellos que han evolucionado para engañar eficientemente a nuestro sistema inmunológico y superarlo. Me parece bastante inverosímil que los OGM muten al azar en algo que es realmente dañino, particularmente si el organismo modificado no es un parásito o una enfermedad, sino un cultivo. Me parece casi como decir que criar perros es muy peligroso, porque cambias el ADN del perro en el proceso.
@Ingi La mutación natural es una cosa. OMG es otra muy distinta. Los OGM no son solo reproducción y selección aceleradas, sino también extracciones y adiciones específicas de ingeniería, y pueden incluir inserciones de ADN de especies cruzadas. Por ejemplo, ADN de bacterias insecticidas en los alimentos. Algunos también están diseñados para hacer que las semillas sean infértiles para que Monsanto pueda hacer que los agricultores dependan de la compra de semillas de Monsanto y no puedan volver a sembrar a partir de semillas. El ADN de los cultivos se extiende a otros campos y cada vez hay menos cultivos libres de transgénicos...
... Entonces podemos terminar con más y más cultivos con propiedades interesantes que se propagan sin control, incluyendo más y más pesticidas y funciones de sabotaje, y menos biodiversidad. Esto desequilibra a las otras especies en toda la cadena alimenticia, y los insectos se comen los cultivos y mueren, las aves se comen a los insectos, etc. Y así vemos muertes masivas de abejas y efectos secundarios relacionados, y el surgimiento de nuevos insecticidas. insectos resistentes, a los que Monsanto sugiere que los cultivos transgénicos contienen aún más pesticidas. Mientras tanto, de repente las personas parecen volverse "intolerantes al gluten" donde antes no lo eran, etc.
Estoy de acuerdo con algunos de sus puntos, simplemente no veo cómo muestran que "GM es peligroso para toda la vida". La mayoría de los ejemplos parecen mostrar más bien que "deberíamos ser más cuidadosos y hacer más pruebas antes de implementar OMG". Los cultivos transgénicos podrían desequilibrar el ecosistema, pero ¿no es lo mismo que hicimos cuando plantábamos cultivos en lugar de bosques y pastizales durante la colonización, esparciendo especies por los continentes? Menos biodiversidad también ocurriría si decidiéramos plantar monocultivos de abetos, por ejemplo. Entonces, el error parece estar en crear monocultivos en lugar de los OGM en sí mismos.
@Ingi No, no es lo mismo que convertir bosques/pastizales en cultivos (lo cual es bastante malo). Los cultivos transgénicos se polinizan de forma cruzada con plantas naturales ni siquiera en el cultivo, y agregan ADN transgénico de otras especies que nunca habrían estado en las plantas naturales, lo que comienza a ser propagado por las aves migratorias por todo el planeta, hasta que eventualmente la mayoría de las especies no transgénicas puede que ya no exista. En este punto, el "deberíamos haber hecho más pruebas - vaya, los elementos de retrovirus que usamos también están causando contaminación genética en los animales" podría ser demasiado tarde... y...
... también, los efectos del ecosistema son mucho más generalizados que simplemente plantar otras plantas que evolucionaron naturalmente. Por ejemplo, las cantidades masivas de pesticidas diseñados para estar dentro de los cultivos alimentarios, tratando tontamente de matar a la mayoría de los parásitos de los cultivos. Primero, eso resulta contraproducente al desarrollar parásitos resistentes a los pesticidas (a los que Monsanto ha estado sugiriendo aún más imprudentemente que se reaccione con aún más pesticidas). En segundo lugar, desequilibra todo el ecosistema mucho más que una especie natural. Si eliminamos casi todos los insectos polinizadores (por ejemplo, las abejas), la mayoría de las especies naturales pueden tener muchas dificultades para reproducirse.