En la investigación moderna del volumen y la función del cerebro hay dos actores principales. FreeSurfer, que es gratuito y de código abierto, y el mapeo paramétrico estadístico más antiguo, pero de uso más frecuente, que en sí mismo también es de código abierto, pero que normalmente se usa dentro de Matlab, que es de código cerrado.
¿Qué debo tener en cuenta al decidir cuál elegir para mi investigación?
Freesurfer es excelente para mapear el grosor cortical utilizando datos anatómicos de resonancia magnética, mientras que SPM se puede usar para comparar dos poblaciones, vóxel por vóxel. Esto es útil para la obtención de imágenes PET. Por ejemplo, puede ver en qué parte del cerebro se produce la captación de amiloide en los pacientes con alzheimer, en comparación con los controles sanos.
Nuestro laboratorio utiliza Freesurfer para procesar datos de resonancia magnética funcional, por lo que no tengo experiencia en el uso de SPM para esto. Sin embargo, diré que probablemente la principal diferencia es que muchos de los procesos de Freesurfer son simples a través de la línea de comandos en UNIX, mientras que SPM tiene una interfaz gráfica fácil de usar.
Sin embargo, SPM también tiene funcionalidad de línea de comandos, por lo que si se siente cómodo con eso, es posible que desee explorarlo. La conclusión es que solo tendrá que experimentar con ambos programas para encontrar el que funcione para usted. Metodológicamente, ambas herramientas deberían brindarle los mismos resultados, por lo que en realidad es solo una cuestión de preferencia y depende de lo que esté estudiando.
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