¿Cómo visualizar puntos de datos científicos bidimensionales en un gráfico... en escala de grises?

No estoy seguro de si este es el sitio correcto para esta pregunta. El modelo proviene de la física, los datos provienen de la física computacional, la trama está hecha con LaTeX, pero mi pregunta es sobre la presentación y el diseño de todo.

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Tengo puntos de datos que dependen de dos parámetros, así que hice un gráfico 3D con ellos:

http://chaos.stw-bonn.de/users/mu/uploads/2014-06-25/mesh.png

Creo que esto da una buena impresión de que los datos se caen para la "a" pequeña y que hay un aumento para la "sigma" de tamaño moderado. Sin embargo, realmente no puedes leer ningún número de esto. Sin embargo, necesito eso.

Así que puse todos los datos en un gráfico bidimensional, codificando el "sigma" con un color. Dado que los puntos de datos se superponen, me resulta útil conectarlos con líneas como esta:

http://chaos.stw-bonn.de/users/mu/uploads/2014-06-25/a-E0-solid-dotted.pdf.png

Para mí, la versión anterior es la versión más legible de todas. Las líneas de conexión entre los puntos no son realmente justificables desde una perspectiva científica, ya que no puedo suponer que describen bien la Física allí. Las únicas cosas que pueden tener algún significado son las líneas interpoladas que he punteado en la versión anterior.

Sería más científico tenerlo así, sin conectar segmentos de línea:

http://chaos.stw-bonn.de/users/mu/uploads/2014-06-25/a-E0-none-solid.pdf.png

Incluso con el color, es más difícil seguir los puntos de cada color. La primera versión me muestra de inmediato que los puntos descienden para la "a" minúscula. Con el segundo, se puede ver, pero solo si lo miras de cerca.

Tal vez pueda usar una línea punteada para ayudar al ojo del lector, pero sin implicar nada, así:

http://chaos.stw-bonn.de/users/mu/uploads/2014-06-25/a-E0-dotted-solid.png

Además, me gustaría evitar el uso de color. Esto se imprimirá un par de veces y las páginas en color tienen un precio diez veces mayor en comparación con las páginas en escala de grises. He intentado dividir los datos en el medio, de modo que ya no se crucen. Esta es la segunda mitad de los datos, los pequeños "sigma". Agregué los segmentos de línea no científicos y ordené la leyenda de arriba a abajo:

http://chaos.stw-bonn.de/users/mu/uploads/2014-06-25/Abbildung-minus1-fein.pdf.png

Creo que esto es legible, excepto por los segmentos de línea de conexión. Dividir los datos en varias parcelas hace que cada parcela sea más fácil de leer, pero es más difícil comparar los datos.

Sin los segmentos de línea, necesito diferentes marcadores para cada conjunto de datos para mantenerlos separados. Esto produce gráficos desordenados de inmediato, por lo que hice que los conjuntos de datos menos importantes fueran un poco más claros.

http://chaos.stw-bonn.de/users/mu/uploads/2014-06-25/Abbildung-minus1-grob.pdf.png

Esto no tiene segmentos de línea y no usa color, pero no creo que sea fácil ver lo que está pasando.

¿Qué podría hacer para que los datos se muestren de forma legible?

Entonces, solo para reiterar: 1. ¿Tiene un número finito de puntos de datos, que tienen dos parámetros en común? 2. ¿ Necesita una solución que funcione exclusivamente en escala de grises? 3. ¿Su visualización deberá transmitir y alentar a las personas a ver la descripción general (relaciones de puntos de datos) _ y_ a estudiar objetos individuales (y sus trayectorias individuales)? ¿Tendrá usted, en algún momento científico en el futuro, que sumar más puntos? crear un gráfico relacional más complejo? ¿Su solución tendrá que ser ampliable?
(1) Sí, todos los puntos dependen de "a" y "sigma", provienen del conjunto de datos 3D. (2) Preferiría una solución en escala de grises debido al costo de impresión, pero solo cuesta unos 15 €. (3) Resumen y sencillo es exactamente lo que quiero decir. Podría agregar un par de puntos más, pero eso debería ser todo. No estoy seguro de lo que quieres decir con "ampliable". Tendré una trama similar con otros datos, pero la idea es la misma.
Ok, creo que te tengo; Propondré algunas sugerencias, pero llevará algo de tiempo, ¡no es un problema trivial! Y perdone mi ignorancia, pero no estoy familiarizado con el significado de "a" y "sigma". Teóricamente, eso podría no tener ningún impacto práctico en mi sugerencia de imágenes, ya que esto es básicamente puntos en un espacio de dos variables. Y hagas lo que hagas: nunca uses 3D para dos variables
Ah, y para aclarar "ampliable": en mi experiencia, un gráfico simple a menudo se vuelve tan ingenioso y útil que se agregan más puntos. Solo soy un fanático de tratar de hacer que las cosas sean "sostenibles", de modo que puedan hacer frente a un aumento significativo en el "peso", es decir, puntos de datos.
"a" es el paso de tiempo en mi simulación. La realidad corresponde a casi cero "a", pero como puede ver en los gráficos, la energía del estado fundamental "E₀" desciende. El "sigma" es el ancho de una curva de campana de Gauss que se coloca sobre el problema con el que trabajo antes de este. Idealmente, cuando ambos estén cerca de 0, obtendría la respuesta que quiero. Este no es el caso, y trato de dejar eso claro en los gráficos. Hacer que las cosas sean sostenibles siempre es una buena idea, eso es correcto :-). Y sé mejor que usar 3D inútil, el manual de mi programa de trazado también dice esto.
Buena pregunta! Recomiendo cambiar el título a algo como "Cómo presentar datos físicos complejos", algo que sea más específico para su pregunta. Tengo la sensación de que esto atraerá algunas miradas de la búsqueda si es un poco mejor, pero no estoy seguro de cómo editarlo mejor :)
@Brendan & Ryan Lo probé y edité el título.

Respuestas (2)

Cuando trabajo con artículos que deben ser todos del 100% y del mismo color, miro las cosas que hacen que los artículos sean distintivos:

  • tamaño (incluido el ancho de los trazos)
  • estilo (guiones, puntos, etc.)
  • relleno (hueco, sólido, patrones)
  • forma

Luego, se trata de cómo puedo ajustar estas cuatro configuraciones para crear suficiente distinción entre los elementos para que sean visiblemente diferentes.

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La variación de guiones en las rutas servirá para crear una distinción entre esos elementos. Probablemente podría refinarse un poco más que lo anterior. Sin embargo, ese parece ser un camino fructífero para esos artículos.

Los indicadores aún no están claros. Jugué con el uso de algunos llenos y algunos huecos, pero nada permitía una distinción clara entre el cuadrado, el diamante y el triángulo. Todos ellos son demasiado similares en forma. Entonces.... Eliminé algunas formas a favor de diferentes rellenos.

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Quité los triángulos porque eran la forma más confusa y se malinterpretaban con facilidad. Los reemplazó con un círculo relleno. También alteré los diamantes para que estén rellenos en lugar de huecos.

Termino con 4 formas distintivas:
- cuadrado hueco
- círculo hueco
- diamante lleno
- círculo lleno

Todavía hay un poco de confusión entre el diamante y el círculo relleno. Entonces, empiezo a pensar en qué forma funcionaría y sería menos como las demás. Hexágono - demasiado similar al círculo, Triángulo - como se indicó, demasiado similar al cuadrado y de tamaño pequeño, no se distingue claramente del círculo. ¿Una estrella tal vez? Sí, pero quizás demasiado decorativa.

Finalmente me decidí por la ruta más mínima, una plaza llena.

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Entonces, termino con 4 formas distintivas que son claramente identificables y 4 caminos distintivos que están claramente separados.

Las diferentes tramas de la otra imagen son un desafío. Alterar los guiones de ruta aún los separaría bien entre sí. Sin embargo, la superposición de las parcelas puede presentar un problema. Sería difícil trazar varias rutas en el mismo punto y que no se vean como una sola ruta, especialmente sin color. En este caso, si es posible, podría explorar tanto los tintes como los guiones. Haciendo de cada parcela un porcentaje de negro. Por lo tanto, cuando se superponen, el negro se vuelve sólido donde se superponen los guiones. Esto puede permitir alguna distinción visual para las plataformas superpuestas. Para ser honesto, necesitaría explorar esto más a fondo (si teñir es una opción) antes de estar seguro.

Me gusta cómo maximizas el contraste de cada propiedad, como la forma, el relleno y el trazo. Teñir está bien, también uso varios tonos en la versión 3D de la trama. Y dado que esto se imprimió en una feria de impresión, asumo que los grises se ven bien.

Este no es un problema trivial; Sólo voy a dar algunas sugerencias generales. Mis gráficos son conceptuales , necesitarían un poco de elegancia para ser óptimos.

Primero: felicitaciones por hacer la malla en el fondo gris claro claro. La gente suele exagerar eso.

¡No subestime el uso de algunos diagramas diferentes para demostrar los mismos datos! Cuando las personas profundizan en las visualizaciones de información, no puede estar completamente seguro de lo que están buscando exactamente, por lo que hacer dos-tres podría ser la mejor solución.

Color

Por supuesto; el color es en muchos casos la forma más fácil, voy a jugar con algunas soluciones diferentes. Primero, sus colores no tienen mucho contraste, y los azules y verdes son particularmente similares. Encontré nueve colores de alto contraste usando ColorBrewer , una herramienta especialmente desarrollada para mapas, y seleccioné la opción de impresión. Los cartógrafos han luchado con esto durante siglos. Puede que los colores no sean muy bonitos, pero ese no es realmente el punto:

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Esto le daría un gráfico más o menos alrededor de esto:

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También sugeriría agregar una leyenda adicional al final de sus gráficos. Hace que sea más fácil recordar la ubicación y tiene el efecto adicional de mostrar dónde terminan los gráficos y poner el "nombre" de cada gráfico más cerca del contexto, y cómo se cruzan entre sí al final (cómo se fusionan/agrupan y cual sube y baja al final (si te interesa). Mantenga también la leyenda "original", preferiblemente en algún lugar a la izquierda. Nuevamente, una ayuda sutil en el mapeo mental (por favor, no siga mi ejemplo en la leyenda del cuadro, ya que los colores no están realmente en un orden sensato).

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Asi que. Este es el resumen de los datos. ¿Qué hacer con la indagación en los detalles? Soy fan de los múltiplos pequeños . Somos máquinas de encontrar patrones y solo necesitamos un poco de ayuda. Pondría el gráfico "grande" al comienzo del documento relevante y luego repetiría la forma con los datos relevantes; con comentarios. Algo como esto, tal vez:

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Un ejemplo de uso de pequeños múltiplos, son Pathline:

...una herramienta de visualización para la genómica funcional comparativa que admite el análisis de tres tipos de datos biológicos a la vez.

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Dado que le preocupa, y con razón, la veracidad de las líneas del gráfico en lo que es básicamente un diagrama de dispersión, puede atenuar las líneas, solo para sugerir. Por ejemplo, haciendo que cada punto de datos sea una "estación de tren" o una diana. de este modo:

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escala de grises

Esto también funcionará en escala de grises. Por supuesto, puede combinar esto con las sugerencias de Scotts de diferentes formas.

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Scott ha cubierto la idea básica de la escala de grises, y puede llevar eso más lejos para usar también los múltiplos pequeños. Ha cubierto la idea general: tienes forma, dirección, densidad, trazo, contraste y ubicación.

¿Qué hacer cuando los trazos se vuelven locos con la superposición, según sus imágenes 2, 4, 5?

Por ejemplo esto, color y escala de grises:

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Para concluir. La regla más importante es no 3D-ificar datos bidimensionales ( vendré y me cagaré en tu buzón ).

¿Qué creo que deberías hacer? Creo que deberías optar por el color, pero úsalo sabiamente. Creo que deberías hacer, digamos, dos representaciones diferentes y luego seguir usando pequeños múltiplos alrededor del texto.

También vale la pena mencionar que personas muy inteligentes han luchado y encontrado soluciones para visualizaciones complejas. Aquí encontrarás una lista de herramientas digitales que bien podrían ser útiles. Parcela en sus datos; generar numerosas versiones.

Avísame si me he olvidado de abordar algo.