¿Qué estaba haciendo Thor?

Las visiones que la Bruja Escarlata le dio a los diversos Vengadores básicamente jugaron con sus peores temores, por ejemplo, Tony vio a los Vengadores muertos porque fracasó; Natasha revivió su entrenamiento en la Sala Roja, etc.

Por alguna razón (que no creo que se explique adecuadamente en la película), la visión de Thor fue mucho más directamente relevante que las demás. Como asgardiano, es probable que Thor sea mucho más consciente del tipo de peligros que existen en el universo más amplio, y también es consciente del hecho de que al menos dos de los Infinity Stones se han puesto en juego recientemente. Esas cosas serían sus "peores temores", algo tan peligroso que literalmente podría destruir todo el universo.

En su visión, ve destellos de esas piedras (incluida la Piedra de la Mente), pero no entiende de inmediato lo que significa, por lo que se va a buscar la respuesta. El lugar al que viaja para obtener esas respuestas es llamado "El Agua de la Vista" por el Dr. Selvig. Nuevamente, no sabemos mucho sobre ellos, excepto lo que Thor y Selvig dicen sobre ellos en esa escena, pero aparentemente son un resorte mágico que le permite a Thor acceder a información que normalmente no tendría.

(Según esta pregunta de ciencia ficción y fantasía, el Agua de la vista probablemente se inspiró en el Pozo de Wyrd de la continuidad de los cómics de Marvel).

Como indica Thor, si las Aguas lo "aceptan", le otorgarán una mejor comprensión de su visión y lo que significa. El conocimiento que obtiene de las Aguas lo lleva a comprender que la Piedra de la Mente está en juego y que necesita asegurarse de que Vision pueda existir y mantener el control de la Piedra.

Esto eventualmente lo lleva a regresar a Stark Tower y ayudar a Tony a crear Vision.