¿Por qué la aconitasa se clasifica como una liasa?

La aconitasa en el ciclo TCA ( ácido tricarboxílico ) isomeriza el ácido cítrico a ácido isocítrico a través del intermedio ácido cis-aconítico. Dado que en general funciona como una isomerasa, ¿por qué no pertenece a las isomerasas? ¿Por qué pertenece a las liasas a pesar de que implica la hidrólisis del agua en el segundo paso? ¿No debería pertenecer a las hidrolasas de esta manera?

Entonces, ¿cómo se puede justificar que sea liasa?

Respuestas (1)

El mecanismo de la aconitasa la clasifica como una liasa, incluso si (en la mayoría de las condiciones fisiológicas), las concentraciones relativas de sustratos dan como resultado que catalice la conversión de citrato en isocitrato. En resumen, no es una isomerasa porque el sustrato se libera después de cada paso .

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Como muestra el mecanismo de la aconitasa, cataliza la conversión de citrato o isocitrato en acónito, así como la reacción inversa. Esto es similar a la reacción catalizada por la fumarasa , que es la adición o eliminación reversible de agua.

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Debido a que las concentraciones fisiológicas de citrato son mucho mayores que la concentración de isocitrato, el acónito en general cataliza la reacción de citrato a isocitrato, y lo hace catalizando dos reacciones de liasa.

Con respecto a la otra parte de su pregunta, las hidrolasas son un grupo completamente diferente de enzimas, y ninguna de las reacciones involucradas está relacionada con las hidrolasas de ninguna manera.

Si bien el agua está involucrada en la reacción, no se usa en el proceso de hidrólisis. Para ser específicos, la hidrólisis (en su sentido enzimático/orgánico y no químico) requiere que el agua sea un sustrato necesario para romper una molécula AB en A y B. Dado que la adición de agua no da como resultado que se descomponga el citrato/isocitrato en dos moléculas orgánicas más pequeñas, la aconitasa no es una hidrolasa.

@ JM97 Respuesta actualizada para aclarar qué es y qué no es una hidrolasa.