Organizador de PDF con jerarquía virtual, visor rápido, resaltado, búsqueda

Ya ha habido muchas preguntas sobre esto en el pasado, aquí por ejemplo. Pero siento que muchos de ellos probablemente estén algo desactualizados, después de todo, 2018 se acerca rápidamente.

Solo estoy en tercer semestre, pero ya comento que estoy a punto de recopilar toneladas de pdf, una buena cantidad de ellos, que me gustaría guardar para leer más adelante. Estoy buscando una herramienta de PDF que me brinde las siguientes características:

  • Organización fluida de los documentos. Quiero tener carpetas/subcarpetas. Si quiero mover documentos de una carpeta a otra, esto debe hacerse muy rápido sin demasiada piratería. La estructura debe ser independiente de la estructura de archivos real en mi disco duro.

  • Un visor de PDF estable en el programa, o la posibilidad de configurar uno predeterminado que abra Documentos. Destacando. Me gusta resaltar, en diferentes colores, y quiero seleccionar el color sin tener que pasar por un montón de opciones de selección para cambiar el color de resaltado. Para mí, los diferentes colores tienen un significado diferente, por lo que esto también debe ser rápido. Lo mismo con las notas. La opción de agregar un cuadro de texto con un acceso directo sería muy apreciada.

  • Velocidad. Descargué Mendeley. Si Skim puede mostrar con fluidez un PDF, espero lo mismo para una herramienta de organización de PDF. No quiero esperar 0,8 s para que se cargue una página si me desplazo rápidamente por un documento. Lo mismo con el zoom. Quiero usar mi trackpad para hacer zoom, o presionar ctrl mientras uso el mouse también está bien. Pero tener que hacer clic en la opción de zoom +/- ciertamente no es una opción.

  • Opciones de búsqueda. A primera vista, me gustó mucho cómo Mendeley muestra tanta información sobre los PDF y solo puedo imaginar lo deseable que se vuelve buscar documentos, por ejemplo, en función de los autores.

  • La capacidad de formar grupos/carpetas, que puedo compartir con otros.

  • Debe estar disponible en macOS, el soporte para Ubuntu sería una ventaja.

  • Comenté que muchas preguntas también eran sobre cosas de Bibtex. Tengo muy poca experiencia con referencias usando Latex, pero supongo que tarde o temprano llegaré al punto en que necesite esas cosas.

¿Cuánto es "muchos" para ti? 100, 10.000, un millón?
Tal vez tenga 200 hasta ahora, pero la tasa de acumulación de nuevos documentos está aumentando rápidamente. Lo que significa que comento que ya (quiero) guardar muchos más PDF que, por ejemplo, al comienzo del semestre.
Es posible que haya subestimado la portabilidad . Después de pasar a una máquina nueva (Mac o lo que sea), a un nuevo sistema operativo o después de pasar a una nueva versión del organizador 5 años más tarde, su antiguo sistema de organización podría desaparecer de forma irreversible.
¿No es específico de la academia?
¡Cada vez que mi cerebro analiza "organizar" devuelve "error de sintaxis"!
"No quiero esperar 0,8 s para que se cargue una página si estoy desplazándome rápidamente por un documento. Lo mismo con el zoom". No tengo ese problema con Mendeley y es una PC de 7 años...
No sé exactamente qué es Mendeley, pero según una breve búsqueda en Google, es un software propietario que cuesta 100 dólares al año, si se usa la nube. La mejor alternativa es Bibtex, que el OP mencionó en la última oración. Bibtex es el cuasi estándar en la publicación relacionada con arxiv y es compatible con herramientas como Jabref y Zotero. Yo personalmente uso un archivo Bibtex al final de mi archivo Lyx para insertar referencias bibliográficas.
@ManuelRodriguez Bibtex no hace nada de lo que pide OP. Aparte tal vez de ser buscable.
@FedericoPoloni No estoy de acuerdo. Trato de explicar cómo el OP puede usar LaTeX/BibTeX en mi respuesta.

Respuestas (3)

Una herramienta que parece cumplir con sus requisitos es Zotero . Lo recomiendo altamente En particular, he tenido una buena experiencia con él en múltiples plataformas y navegadores web, incluido Ubuntu con Chrome y Firefox.

Zotero le permite organizar su colección de documentos en carpetas y puede almacenar el mismo elemento en varias carpetas (colecciones en la terminología de Zotero). Puede adjuntar un .pdf de un artículo a los datos bibliográficos de ese artículo y Zotero puede buscar dentro del contenido de sus archivos .pdf. Zotero se integra bien con Biblias y Latex.

captura de pantalla
Zotero (fuente: Wikipedia ; haga clic en la imagen para una variante más grande)

Zotero usa la licencia AGPLv3. Puede encontrar más detalles, por ejemplo, en Wikipedia .

También tiene buenas funciones de exportación con complementos, por lo que no lo bloqueará en un software/flujo de trabajo en particular. Y es FLOSS.
Incluya información de la licencia, detalles sobre el zoom y el resaltado, y una captura de pantalla, ¡gracias!
¿Podría también describir cómo se puede usar Zotero para la gestión de documentos, como solicitó OP? Se describe como "software de gestión de referencias", que se ocupa principalmente de citas (aunque se pueden adjuntar archivos PDF).

Yo uso una herramienta llamada TheBrain.

Puede descargar una versión de prueba. No es gratis, pero si tu vida profesional o académica depende de herramientas, querrás la ayuda más adecuada.

Puede ver un tutorial en tutoriales y, en particular, es posible que desee ver el seminario web en Uso de TheBrain para la gestión visual de archivos

Suelen hacer demostraciones en cajas de Windows, pero yo lo uso en macOS (Mac Mini, High Sierra)

Ver también Esta tabla de comparaciones que muestra características de programas como Zotero (pero no TheBrain).

Mis mejores deseos ... saludos, drl

Escriba una revisión de la literatura en LaTeX usando BibTeX para administrar sus referencias.

Asegúrese de que cada entrada de BibTeX tenga suficiente información para acceder al manuscrito correspondiente. Generalmente no incluyo ninguna información: puedo buscar en Google Scholar usando el título y eso me da acceso al manuscrito. A veces es increíblemente difícil acceder a un manuscrito, en tales casos incluyo una URL en mi entrada de BibTeX. En retrospectiva, debería haber incluido el DOI de cada manuscrito, cuando estaba disponible.

Creo que este método logra sus objetivos y la revisión de la literatura proporciona un rico recurso de información. Además, lo más probable es que la revisión se pueda publicar en algún momento.

Organización vs Visualización . Esta respuesta trata solo con el aspecto de organización de la pregunta. Aunque, adoptar esta respuesta probablemente cambiará las necesidades de visualización. (Por ejemplo, las notas aparecerán en la revisión de la literatura en lugar de como anotaciones en los trabajos de investigación). El aspecto de visualización simplemente requiere elegir el visor de PDF correcto. Las opciones para Linux incluyen Foxit Linux PDF Reader, GNU GV, Mupdf, Okular, Qpdfview y XPDF.

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