Creo que leí en otras preguntas aquí que puede restablecer su teléfono a la configuración de fábrica para deshacerse de la mayoría de las cosas malas que la gente común puede poner en secreto en su teléfono, como aplicaciones de espionaje, malware, virus, etc.
Después del reinicio, si restaura los datos de respaldo de su tarjeta SD, ¿puede obtener las mismas cosas malas?
Sí, suponiendo que tuviera algunas "cosas malas" en la copia de seguridad para empezar. Por ejemplo, si instaló una aplicación maliciosa de terceros que encontró en un sitio aleatorio, luego hizo una copia de seguridad junto con su configuración en una tarjeta SD, luego borró/restableció el teléfono a la configuración de fábrica y luego volvió a insertar la tarjeta SD con su copia de seguridad y restauró la aplicación maliciosa a partir de su copia de seguridad, básicamente ha vuelto al punto de partida.
Si sospecha que tiene un sistema infectado/comprometido y está restableciendo/borrando todo de fábrica para comenzar con un sistema "limpio", puede ser prudente volver a descargar y luego reinstalar todas las aplicaciones desde una buena fuente conocida en lugar de que restaurar desde una copia de seguridad.
Si sospecha que el malware puede haber tenido acceso a la raíz, puede considerar volver a descargar y volver a actualizar la ROM original como precaución adicional utilizando una actualización descargada directamente del fabricante. (Esto se debe a que el malware puede haberse instalado en el directorio /system, es decir, el software de firmware en sí).
Este no es un método 100% a prueba de fallas para estar seguro de haber eliminado todos los rastros de malware (una vez que tiene la raíz, el malware teóricamente podría instalarse en otras particiones inusuales como la radio/banda base, etc. pero esto sería difícil, dispositivo- específico, y no he oído que esto suceda nunca... todavía), así que sospecho que esto debería ser efectivo.
Pero sí, no borre todo solo para restaurar desde una copia de seguridad de su sistema que tiene el problema original...