¿Herramienta en línea para dibujar compuestos orgánicos y exportarlos a SVG?

Lamentablemente, mi editor en línea favorito recientemente, draw.io , no admite el dibujo de compuestos orgánicos o químicos, pero miré la lista de editores de Moléculas en línea y busqué una exportación SVG provista.

Tal vez más de uno lo admita, pero encontré uno que admite la exportación SVG (aunque se llama "Imagen SVG"), y ese es el editor de moléculas en línea PubChem , que admite SMILES, SMARTS e InChI, así como todos los formatos de archivos químicos comunes. .

La interfaz está un poco anticuada, pero parece que es posible dibujar cosas con bastante rapidez y, de hecho, exporta a SVG (seleccione "Imagen SVG" y presione el botón "Exportar"). Pruébelo y vea si te conviene Si no, prueba algunas de las alternativas de la lista de Wikipedia vinculada en la parte superior.

Actualmente estoy trabajando en un proyecto C#/.NET en el que puede dar el nombre de un compuesto orgánico y se generará la imagen del compuesto.

El código de la consola y la aplicación WPF se pueden encontrar aquí https://github.com/thieupepijn/OrganicCompoundVisualizerWinApps

La biblioteca detrás de estas aplicaciones se puede encontrar aquí https://github.com/thieupepijn/OrganicCompoundVisualizerLibraries

Exportar a SVG aún no es compatible, pero tal vez lo ponga en mi lista de tareas pendientes.

Sin embargo, si está dispuesto a codificar, puede agregar fácilmente esta función usted mismo.

Creo que está buscando python + python-indigo , (la documentación se puede encontrar aquí ; al momento de escribir, los enlaces con las fuentes de github están rotos).

• Gratis y GPL
• Compatibilidad con formatos de entrada: Molfiles/Rxnfiles v2000 y v3000, SDF, RDF, CML, SMILES, SMARTS.
• Portabilidad: se proporcionan paquetes binarios preconstruidos para Linux y Windows (tanto de 32 bits como de 64 bits), y también para sistemas Mac OS X (tanto 10.5 como 10.6).
• Representación de moléculas y reacciones. La mejor calidad de imagen entre todos los productos disponibles. Fácil compatibilidad con SVG .
• Diseño automático para moléculas y reacciones representadas por SONRISAS.
• Cálculo canónico (isomérico) de SONRISAS.
• Coincidencia exacta, coincidencia de subestructura, coincidencia SMARTS.
• Emparejamiento de tautómeros y estructuras de resonancia.
• Huella dactilar de moléculas, cálculo de similitud de moléculas.
• Enumeración rápida de anillos SSSR, subárboles y subgráficos de borde.
• Peso molecular, cálculo de fórmulas moleculares.
• Deconvolución de R-Group y detección de andamios. Trabajo pionero en el cálculo de la subestructura común máxima exacta para una cantidad arbitraria de estructuras de entrada.
• química combinatoria
• Compatibilidad con complementos en la API. Como referencia, consulte el complemento Renderer distribuido junto con la API de Indigo.

Se pueden encontrar algunos ejemplos en el manual , los archivos reales no se cargan porque son SVG, que no se admite aquí :

Si desea dibujar tales moléculas usted mismo, en lugar de hacerlo automáticamente, puede usar InkScape .

• Gratis
• Soporte SVG - definitivamente
• Puede dibujar lo que quiera, pero no generará el dibujo a partir de la fórmula.