Guarde el archivo en un directorio oculto con el cuadro de diálogo de guardado estándar de OS X

La forma integrada de hacer esto mediante el uso de una combinación de teclas en los cuadros de diálogo Guardar/Abrir para cambiar los archivos ocultos a visibles u ocultos

Actualizar: este acceso directo funciona en todas las vistas, pero en la vista de columna no actualiza la vista para mostrar el cambio hasta que navegue a otro directorio. No estoy seguro de por qué este es el comportamiento. Pero puede cambiarlo en la vista de columna, haga clic en otra carpeta (en la columna principal a la izquierda) y vuelva a ver si ha cambiado.

Cuando esté en el diálogo Guardar o Abrir de la aplicación.

Mantenga presionadas las teclas CMD+ shift y luego . al mismo tiempo.

Esto alternará los archivos/carpetas ocultos en el cuadro de diálogo Guardar o Abrir.

[alternado para ocultar archivos/carpetas invisibles]

[alternado a Mostrar archivos/carpetas invisibles]

Nota: no es necesario que los archivos/carpetas ocultos estén visibles en el buscador. Esta opción funciona de forma independiente.

¿Qué versión de OS X estás usando?
Cuando probé esto en Yosemite, si ingresé ~o /apareció esto:

en el que puede ingresar la ruta al directorio de su elección.

Además, si solo pones en el directorio como

~/Biblioteca

Luego, llevará el selector de archivos a ese directorio y le permitirá profundizar.

Refiriéndose a la captura de pantalla en su pregunta original: simplemente arrastre la carpeta (_EXTERNAL_DATA...) desde la ventana del Finder a la derecha hasta el cuadro de diálogo Guardar a la izquierda. El cuadro de diálogo Guardar ahora estará ubicado en la carpeta que arrastró a él.

Si ya ha abierto la carpeta en la ventana del Finder, simplemente arrastre el icono de la carpeta pequeña desde la barra de título de la ventana del Finder (la que está directamente a la izquierda del título de la ventana).

Me gusta bastante la solución 'Ir a la carpeta' en otra respuesta, pero si ya tiene abierta la otra ventana, creo que esto es aún más rápido.

Al presionar ⌘⇧G (Cmd+Shift+G) en cualquier ventana del Finder o en el cuadro de diálogo estándar para abrir/guardar archivos, aparecerá un pequeño mensaje:

Puede ingresar cualquier ruta que desee en este indicador. Si usa ⌘⇧G para llegar a este mensaje, se mostrará la última ruta que ingresó, lo cual es muy útil para guardar varios archivos en el mismo destino oculto.

En los cuadros de diálogo Abrir o Guardar, también puede acceder a este indicador presionando las teclas ~ o /, que rellenarán automáticamente el cuadro de diálogo con ~ (directorio de inicio) o / (directorio raíz). La ventaja de usar Cmd+Shift+G es que esta combinación de teclas recordará la última ruta que escribiste, y también funciona en Finder (~ y / rellenan previamente el cuadro de diálogo y solo funcionan en los cuadros de diálogo Abrir o Guardar).

Además, el indicador admite una forma limitada de completar con tabulación; al presionar Tabulador en la ventana, se completará automáticamente la ruta utilizando la primera entrada alfabética que comienza con lo que haya escrito. Esto puede ser muy útil para navegar rápidamente por su sistema de archivos incluso cuando los archivos no están ocultos.

¿Qué sucede si agrega dicha carpeta oculta a la barra lateral del Finder? Luego aparecerá en un panel de abrir/guardar.

Por ejemplo, me meto en ~/Library de vez en cuando, lo suficiente como para agregarlo a la barra lateral. Ahora, cuando voy y abro o guardo el panel, puedo saltar directamente a él.

Nota al margen: si usa DefaultFolderX (que tiene muchas otras funciones útiles), puede configurar una 'opción avanzada' para que todo lo que necesite mantener presionada sea la tecla Opción cuando seleccione Abrir o Guardar para poder acceder a todos los archivos/carpetas .