No pude encontrar una buena respuesta directa a la pregunta, pero aquí hay algo a considerar con respecto a esta regla.
Personalmente, nunca he usado esta regla y, al leer la documentación , parece que es redundante de todos modos:
[Esta regla] detecta pines que no tienen red asignada ni pistas de conexión.
Básicamente, esta regla solo encontrará pines que no tengan una red asignada. Los pines NC son muy comunes, por lo que debe usar la regla de redes no enrutadas en el nivel de PCB.
Los pines no conectados deben verificarse en el nivel esquemático (ejecutar ERC antes de enviar cambios a la PCB) y puede usar No ERC para marcar los pines que están desconectados por diseño.
Parece que tiene una falta de sincronización entre el esquema y la PCB. Pruebe Proyecto->Mostrar diferencias y asegúrese de haber compilado todo sin errores antes de hacer Diseño->Actualizar PCB
Editar: como señala Armandas, las directivas ERC no se transfieren, por lo que una forma sería alterar las reglas de diseño para no verificar si hay pines desconectados. Puede hacerlo cambiando las reglas o no marcando durante DRC (desmarque la casilla de pin no conectado).
Armanda
Spehro Pefhany