¿Cómo murió Orochimaru por segunda vez?

Orochimaru técnicamente nunca ha muerto. Durante el tiempo al que se hace referencia, Itachi lo había "sellado".

Esta es una respuesta de dos partes, así que aquí vamos.

1.) A este tipo se le atribuye esta gloriosa explicación, porque no podría haberlo dicho mejor.

Muy bien, trataré de explicar esto de la manera más fácil posible, porque puede ser muy confuso. Primero, comencemos con la marca de maldición de Orochimaru, también conocida como Juinjutsu de Orochimaru, Orochimaru inyecta a la víctima una mezcla de la enzima de transformación de Jugo, el chakra Senjutsu de Orochimaru y algo de la propia conciencia de Orochimaru. Con su propia conciencia en la víctima, Orochimaru puede controlar de forma remota la marca maldita y al usuario hasta cierto punto. Esto se muestra por la voluntad de Orochimaru manipulando la propia voluntad de Sasuke durante el uso de Sasuke de su respectiva marca de maldición. Ahora para su pregunta. El cuerpo de Orochimaru puede ser completamente destruido o sellado y aún no puede considerarse completamente muerto. Mientras quede al menos una marca de maldición, la conciencia de Orochimaru seguirá existiendo dentro de una persona, es decir, Anko, y está al tanto de todas las actividades que suceden a su alrededor. El problema es que Orochimaru no puede influir en estos eventos de ninguna manera, ya que no tiene forma física. Sin embargo, si alguien, por ejemplo, Sasuke, usa el Método de Liberación del Mal, en una víctima de la Marca de Maldición, la Marca de Maldición será liberada y la mezcla de objetos previamente mencionados será liberada. Entonces, si por alguna razón, hubiera algo del ADN de Orochimaru por ahí, la conciencia de Orochimaru usaría el Senjutsu Chakra y la Enzima de Jugo para restaurarse a sí mismo a un estado físico. En conclusión, Orochimaru se puede traer de vuelta varias veces, lo que implica que se cumplen un conjunto específico de requisitos, ya que así fue, Orochimaru ha vuelto a la vida. Pero no puede existir dos veces ya que tiene una sola alma. Aparentemente escapó del sellado de la Totsuka Blade de Itachi,

2.) Este sitio ofrece una descripción del episodio de Orochimaru siendo 'sellado' en el episodio 'Batalla predestinada entre hermanos'. Particularmente importante es la última oración.

Durante la batalla con Itachi, Sasuke se quedó sin chakra y Orochimaru pudo emerger de su sello maldito usando su característica Técnica de las Ocho Ramas. Se maravilló por el hecho de que finalmente tendría la oportunidad de tomar el cuerpo de Sasuke, pero inmediatamente fue atravesado por la espada que sostenía el Susanoo de Itachi. Al principio, Orochimaru se jactó de que se necesitaría más que eso para matarlo, pero pronto se dio cuenta de que había sido atravesado por la Espada Totsuka que él mismo había estado buscando. Orochimaru luego fue sellado por el Susanoo de Itachi, lo que tuvo el efecto de eliminar el sello maldito de Sasuke en el proceso. Tres serpientes blancas escaparon del cuerpo de Orochimaru cuando fue sellado, pero al menos una de estas serpientes fue posteriormente asesinada por las llamas negras de Amaterasu.