¿Cómo encontrar correctamente el RMS en el microcontrolador ARM 7 LPC?

Estoy tratando de encontrar el RMS de una onda sinusoidal de entrada usando el microcontrolador ARM 7 LPC 2119. Conozco la teoría detrás de encontrar el RMS de tal forma de onda, pero tengo problemas para implementar esto en el código, especialmente el muestreo en coordenadas medias igualmente espaciadas. También acabo de usar interrupciones de temporizador para encontrar la frecuencia de una onda sinusoidal usando entradas de captura, por lo que conozco las funcionalidades básicas en términos de programación de un microcontrolador ARM 7 LPC 2119.

Estoy probando esta funcionalidad utilizando una onda sinusoidal de pico a pico de 3 V con una frecuencia de 50 Hz. He desplazado la forma de onda hacia arriba en 1,5 V para evitar que entren valores negativos en los pines ADC del microcontrolador.

Para muestrear a intervalos igualmente espaciados, estoy usando interrupciones de temporizador, de una manera muy similar a este ejemplo aquí . En lugar de encender un LED, estoy haciendo una conversión ADC.

Antes de usar la siguiente fórmula:

Necesito asegurarme de que estoy muestreando en intervalos dados, y para probar esto, configuré mi reloj temporizador para proporcionar un retraso de 20 ms antes de ingresar a la función ADC al hacerlo:

T0CTCR = 0x0; //Set Timer Mode
T0PR = 60000-1; //Increment T0TC at every 60000 clock cycles
//60000 clock cycles @60Mhz = 1 mS

T0MR0 = 21-1;   //Zero Indexed Count-hence subtracting 1
T0MCR = (1<<0) | (1<<1);//Set bit0 & bit1 to Interrupt & Reset TC on MR0  

Una vez hecho esto, habilito mi interrupción del temporizador:

  VICVectAddr0 = (unsigned )timer0ISR; //Pointer Interrupt Function (ISR)
  VICVectCntl0 = (1<<5) | 4; //(bit 5 = 1)->to enable Vectored IRQ slot 
  VICIntEnable = (1<<4); // Enable timer0 interrupt

El código anterior da un retraso de 20 ms. Con una onda sinusoidal a 50 Hz, debería dar el mismo valor en cada lectura, ya que el período de dicha onda sinusoidal también es de 20 ms. Sin embargo, este no es el caso y no puedo ver ningún patrón visible en mis resultados.

La función ADC que estoy usando funciona bien con voltajes de CC y también puedo confirmar que el temporizador está dando un retraso de 20 ms antes de ingresar a la función ADC.

¿Me estoy perdiendo algo obvio aquí o podría haber otras variables que no estoy teniendo en cuenta? Cualquier idea sería apreciada.