autogen.sh no funciona en Ubuntu en Windows

Esto significa que su archivo tiene líneas nuevas de DOS, por lo tanto, caracteres CR ocultos al final. Por lo tanto, set -ese convierte set -e$'\r'(usando la sintaxis específica de bash para representar el carácter CR), que no es una opción válida.

Para solucionar esto, si tiene dos2unix instalado, puede ejecutar:dos2unix autogen.sh

Así es como resolví el problema usando Git en Windows. Tenga en cuenta que restablecerá su local con maestro.

git config --global core.autocrlf false
git reset --hard origin/master

Luego pude usar el subsistema Ubuntu en Windows para ejecutar ./autogen.sh sin el error en el OP.

Parece que estás en el directorio equivocado ya que en el bitcoindirectorio definitivamente está el archivo autogen.sh.

¿ Estás seguro de que estás en el mismo bitcoindirectorio que acabas de clonar? ¿ Qué lsdevuelve (listar el contenido del directorio)?