Android sigue perdiendo los valores predeterminados de inicio, la configuración de la aplicación y las actualizaciones instaladas y las aplicaciones instaladas después de cada reinicio

Después de cada reinicio, Android sigue perdiendo los valores predeterminados de inicio, algunas configuraciones de aplicaciones e incluso algunas de las actualizaciones y aplicaciones instaladas.

Volví a actualizar el firmware original y luego apliqué todas las actualizaciones de OTA. Después de eso, solo flasheé TWRP, GApps (Pico Uni) y SuperSU.

Dado esto, probé varios restablecimientos de fábrica (desde Configuración), pero cada vez, después de instalar una cierta cantidad de aplicaciones, algunas de las anteriores comienzan a desaparecer con cada reinicio. A medida que variaba la secuencia de aplicaciones instaladas, los datos perdidos son cada vez algo más. Los ejemplos de diferentes restablecimientos de fábrica incluyen:

• aplicación predeterminada perdida para buscar en el botón de Inicio tocar y arrastrar
• aplicación predeterminada perdida para el navegador
• Preferencias de Gmail perdidas (Globales) y/o indicador de sincronización de cuenta
• actualizaciones de Motorola Camera y Motorola Gallery (a través de Play Store)
• algunas de las aplicaciones que acabo de instalar (a través de Play Store) desaparecen después de reiniciar
• El almacenamiento interno pasa a ser de solo lectura para las aplicaciones (incluso las rooteadas), pero se puede escribir para Android File Transfer

Lo que probé hasta ahora:

• borrando el caché y el caché dalvik, en realidad después de casi todas las aplicaciones instaladas y, por supuesto, después del restablecimiento de fábrica
• desinstalar y reinstalar todas las aplicaciones en cuestión
• restablecimiento manual de los valores predeterminados de la aplicación en Configuración> Aplicaciones, tanto globalmente como para aplicaciones individuales
• ninguna de las aplicaciones instaladas en SD / almacenamiento interno, por lo que no debería ser un problema

Lo que no probé incluyen:

• borrar el almacenamiento interno y la tarjeta SD (la mayoría de las aplicaciones se "movieron previamente a SD")
• cualquiera que sea el formateo o el reparticionamiento de las particiones de Android

¿Alguna idea de qué probar a continuación?

Tengo Moto G 2da generación (XT1079 dual-SIM). Ejecuta Android actualizado automáticamente desde stock 5.0.2 22.36.1 (compilación LXB22.99-7.1) a stock Lollipop 5.0.2 22.46.7 (compilación LXB22.99-24.7).